163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0262 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  100 
 
 		 199 aa  364  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  51.27 
 
 		 360 aa  168  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0157  protein of unknown function UPF0016  54.82 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  51.1 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6418  protein of unknown function UPF0016  44.16 
 
 		 198 aa  138  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00518335  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  40.49 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  44.56 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  44.2 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  41.71 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0022  protein of unknown function UPF0016  46.31 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  39.68 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  36.92 
 
 		 192 aa  95.5  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  35.36 
 
 		 196 aa  91.3  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  36.13 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  37.44 
 
 		 187 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  36.36 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  35.23 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  32.04 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  35.26 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  34.29 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  37.71 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  37.14 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  37.14 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  37.14 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  37.14 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  37.14 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  37.14 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  37.14 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  32.74 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  35.96 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  32.74 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  35.79 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  36.57 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  36 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  36 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  34.09 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  35.43 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  34.86 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  35.43 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  35.43 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  35.43 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31737  predicted protein  31.82 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  34.1 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  29.31 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1416  protein of unknown function UPF0016  30.5 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000085126  normal  0.0435338 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  30.98 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  32.57 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  28.74 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  32.76 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  32 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  32.94 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0782  hypothetical protein  39.9 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.527529  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  31.87 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  35.48 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  33.68 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  32.39 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  33.88 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  29.86 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  32 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  31.32 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  29.31 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  25.54 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  33.52 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2025  hypothetical protein  30 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  35.14 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  35.14 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  33.33 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  32.61 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  31.43 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  28.22 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  30.39 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  32.8 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  32.96 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  30.89 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  31.55 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  32.02 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  31.43 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  33.88 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  34.34 
 
 		 115 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  34.12 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6052  predicted protein  26.96 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388708  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  31.32 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  31.84 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  32.97 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  36 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  33.15 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  32.6 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  30.94 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  32.98 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  29.12 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  29.71 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  33.9 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  30.69 
 
 		 115 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  31.82 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  32.24 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  31.28 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  28.11 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  28.26 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1965  hypothetical protein  31.28 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.525919  normal  0.107864 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>