180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0782 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0782  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  380  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.527529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  71.79 
 
 		 195 aa  289  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  61.26 
 
 		 192 aa  227  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  61.78 
 
 		 192 aa  224  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  61.88 
 
 		 196 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  43.68 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  43.43 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  39.23 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  38.83 
 
 		 360 aa  99.4  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  38.33 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  38.71 
 
 		 256 aa  94  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  36.67 
 
 		 215 aa  92.8  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  35.98 
 
 		 204 aa  91.3  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  36.67 
 
 		 216 aa  91.3  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  33.87 
 
 		 212 aa  90.9  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  38.33 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  39.01 
 
 		 261 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  36.67 
 
 		 216 aa  89.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  35.91 
 
 		 197 aa  89.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  36.67 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  35.56 
 
 		 213 aa  88.6  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  38.66 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  38.42 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  39.06 
 
 		 221 aa  85.5  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  34.27 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  37.77 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  34.68 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  34.57 
 
 		 219 aa  81.3  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  36.56 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  35.29 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  36.87 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  34.55 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  30.69 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  35.48 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  30.89 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  36.27 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  33.16 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  32.8 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  30.61 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  34.95 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  33.51 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  31.96 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  30.77 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  32.8 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  30.73 
 
 		 220 aa  72  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6418  protein of unknown function UPF0016  36.46 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00518335  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  34.57 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  35.58 
 
 		 302 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  32.8 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  32.8 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  32.98 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  34.57 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  34.74 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  32.77 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  34.74 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  31.32 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  32.26 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  31.69 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  34.21 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  34.41 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  31.05 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  32.98 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  27.94 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  32.26 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  46.91 
 
 		 122 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  32.26 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  30.77 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0682  hypothetical protein  33.51 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0022  protein of unknown function UPF0016  37.5 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0914  hypothetical protein  33.87 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  32.09 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  32.07 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  32.07 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  32.07 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  32.07 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  32.07 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  32.07 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  32.07 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  30.22 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  33.87 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  31.41 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  33.16 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3880  hypothetical protein  30.39 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000226161  hitchhiker  0.000000250469 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  29.89 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  33.51 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  30.32 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  31 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  33.15 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  28.88 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  31.55 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  30.26 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  30.48 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  29.83 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  29.95 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  32.63 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>