160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1990 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  426  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  51.96 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1416  protein of unknown function UPF0016  45.54 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000085126  normal  0.0435338 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  45.54 
 
 		 207 aa  167  9e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  45.88 
 
 		 230 aa  141  7e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15159  predicted protein  38.61 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000205164  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31737  predicted protein  39.22 
 
 		 212 aa  123  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6052  predicted protein  35.68 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388708  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45794  predicted protein  31.39 
 
 		 286 aa  100  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12265  predicted protein  34.23 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166201  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7690  predicted protein  39.3 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.113136  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  32.16 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  33.33 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  37.7 
 
 		 256 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  37.97 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  38.58 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1998  hypothetical protein  31.19 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.579109  normal  0.0445396 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  32.49 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  32.63 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04690  vacuole protein, putative  40.45 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  30.27 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  30.15 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  31.03 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  34.39 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  28.87 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  31.03 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  33.5 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  27.69 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  32.26 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  32.14 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  32.14 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  31.63 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  31.63 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  33 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  31.63 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  30.62 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  28.22 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  29.21 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  33.16 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  30.14 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  32.99 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  31.4 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  30.66 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  27.72 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  31.52 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  32.8 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  30.61 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04814  UPF0016 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07080)  37.11 
 
 		 516 aa  65.5  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0310386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  30.61 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  30.61 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  30.61 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  28.57 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  31.77 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  31.77 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  32.8 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  32.8 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  29.33 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  31.77 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  31.77 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  31.77 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  31.77 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  31.77 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  30 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  25.59 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  31.09 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  32.28 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  29.53 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  31.12 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  31.02 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  32.45 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  29.65 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  28.86 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  30.26 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  30.1 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  30.14 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  30.08 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  28.87 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  31.35 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  28.87 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  32.65 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  29 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  30.14 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  30.46 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  27.45 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  30.61 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  30.11 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  32.6 
 
 		 302 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  30.11 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  29.02 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  27.45 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  32.35 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  31.12 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  31.38 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  30.13 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  30.5 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  32.83 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  28.5 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  22.17 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0782  hypothetical protein  30.54 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.527529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>