62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_7690 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_7690  predicted protein  100 
 
 
205 aa  397  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.113136  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12265  predicted protein  48.53 
 
 
208 aa  131  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166201  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  43.55 
 
 
230 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1416  protein of unknown function UPF0016  38.24 
 
 
205 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000085126  normal  0.0435338 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  38.69 
 
 
207 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  37.38 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  37.75 
 
 
220 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31737  predicted protein  37.85 
 
 
212 aa  98.2  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452882  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6052  predicted protein  31.6 
 
 
218 aa  89.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388708  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45794  predicted protein  31.17 
 
 
286 aa  89  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15159  predicted protein  33.33 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000205164  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  31.66 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  31.79 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  31.47 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  31.91 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  28.36 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  33.5 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  26.37 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  28.35 
 
 
216 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  27.84 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  30.05 
 
 
270 aa  61.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  27.84 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  27.36 
 
 
231 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  26.49 
 
 
190 aa  59.3  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  28.22 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  29.15 
 
 
212 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04690  vacuole protein, putative  34.44 
 
 
302 aa  58.2  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  30.05 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04814  UPF0016 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07080)  35.48 
 
 
516 aa  56.6  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0310386  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  29.65 
 
 
196 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0157  protein of unknown function UPF0016  30.69 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  30.21 
 
 
197 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  31.22 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  29.69 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  26.96 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  29.35 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  28.28 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  29.21 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  28.06 
 
 
360 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  30.85 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  28.93 
 
 
238 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1998  hypothetical protein  29.02 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.579109  normal  0.0445396 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  30 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  31.16 
 
 
187 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  28.5 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  27.27 
 
 
188 aa  48.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  31.73 
 
 
203 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  26.37 
 
 
235 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  32.62 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  28.04 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  31.16 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  28.28 
 
 
184 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  26.13 
 
 
235 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  29.38 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  26.8 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  26.8 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  27.32 
 
 
190 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  31.46 
 
 
221 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  29.14 
 
 
190 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  27.64 
 
 
191 aa  42  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  25.87 
 
 
235 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  25.87 
 
 
235 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>