130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01050 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  100 
 
 		 199 aa  370  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  51.1 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  47.13 
 
 		 360 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  46.24 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  33.6 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  38.5 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6418  protein of unknown function UPF0016  38.78 
 
 		 198 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00518335  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  44.26 
 
 		 239 aa  104  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0157  protein of unknown function UPF0016  44.21 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0022  protein of unknown function UPF0016  38.58 
 
 		 198 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  32.26 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  35.26 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  31.25 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  32.47 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  32.39 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1416  protein of unknown function UPF0016  31.09 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000085126  normal  0.0435338 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  30.17 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  28.28 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  26.63 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  49.33 
 
 		 94 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  32.63 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  30 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  28.72 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  31.25 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6052  predicted protein  25.24 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  28.72 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  32.18 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  30.53 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  30.05 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  33.67 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  36.47 
 
 		 132 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  34.29 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  28.57 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  29.53 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  29.53 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  29.53 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  29.53 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  29.53 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  29.53 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  29.53 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  31.15 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  28.04 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  34.69 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  30.85 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  27.37 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  31.41 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  31.38 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  31.41 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  30.98 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  33.67 
 
 		 115 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  26.9 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  30.27 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  30.77 
 
 		 256 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  26.5 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  31.75 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  29.28 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  30.6 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  35.56 
 
 		 151 aa  51.2  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  30.05 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  32.42 
 
 		 261 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15159  predicted protein  24.51 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000205164  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  27.55 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  30.77 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  28.32 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  33.72 
 
 		 120 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  31.68 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  31.72 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  36.14 
 
 		 121 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  28.14 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  30.77 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  39.47 
 
 		 90 aa  49.7  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  32.04 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31737  predicted protein  32.11 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  38.96 
 
 		 124 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  28.96 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  29.02 
 
 		 184 aa  48.9  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  28.95 
 
 		 234 aa  48.5  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  31.72 
 
 		 205 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  33.75 
 
 		 97 aa  48.5  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  28.72 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  30.41 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  27.32 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  28.93 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  30.41 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  27.32 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  27.32 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  41.89 
 
 		 112 aa  47  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  40.54 
 
 		 110 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  34.62 
 
 		 115 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  28.79 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  27.78 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  28.79 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  30.1 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  28.32 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  27.51 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  28.34 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  27.62 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  27.69 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0782  hypothetical protein  32.61 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.527529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  31.49 
 
 		 235 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>