132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1998 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1998  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  395  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.579109  normal  0.0445396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  30.39 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  29.35 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  30.65 
 
 
220 aa  82  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  29.53 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  33.16 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1416  protein of unknown function UPF0016  30.46 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000085126  normal  0.0435338 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6052  predicted protein  27.23 
 
 
218 aa  68.2  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  30.3 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  31.98 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  31.82 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45794  predicted protein  28.97 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  29.38 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  29.5 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  33.67 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  31.47 
 
 
234 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  28.43 
 
 
192 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  29.95 
 
 
191 aa  62  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  29.51 
 
 
201 aa  61.6  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  29.56 
 
 
203 aa  61.6  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  28.57 
 
 
204 aa  61.6  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  29.69 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  31.53 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  33.7 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12265  predicted protein  31.03 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166201  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  32.65 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  28.57 
 
 
185 aa  59.3  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15159  predicted protein  27.36 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000205164  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31737  predicted protein  28.78 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452882  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  29.15 
 
 
184 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  30.61 
 
 
218 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  30.96 
 
 
218 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  30.61 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  30.96 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  30.61 
 
 
218 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  30.61 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  28.65 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  28.06 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  28.57 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  28.65 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  28.64 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  28.65 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  28.65 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  28.65 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  28.65 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  28.65 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  30.46 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  28.28 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  27.27 
 
 
186 aa  56.6  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  28.28 
 
 
192 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  32.16 
 
 
190 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  28.92 
 
 
189 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0782  hypothetical protein  28.87 
 
 
195 aa  54.7  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.527529  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  26.96 
 
 
216 aa  53.9  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  27.36 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  28.5 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  28.06 
 
 
241 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  29.21 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  29.21 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  28.93 
 
 
261 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  36.36 
 
 
132 aa  52.4  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  26.7 
 
 
190 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  28.36 
 
 
212 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  30.24 
 
 
192 aa  52  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  27.86 
 
 
204 aa  51.6  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  32.85 
 
 
239 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  27.75 
 
 
187 aa  51.6  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  29.5 
 
 
196 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  26.13 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  26.63 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  31.79 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  30.2 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  29.35 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  27.94 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  27.27 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  32.17 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  33.72 
 
 
116 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  36.08 
 
 
110 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  33.81 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  28.43 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  26.8 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  27.55 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  28.64 
 
 
187 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  26.18 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  28.43 
 
 
199 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  31.47 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  34.65 
 
 
124 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  26.83 
 
 
238 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  38.75 
 
 
112 aa  48.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  28.42 
 
 
189 aa  48.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  37.21 
 
 
115 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  32.17 
 
 
115 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  37.66 
 
 
138 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  35.97 
 
 
194 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  27.55 
 
 
231 aa  47  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  33.01 
 
 
121 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  30.22 
 
 
270 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  26.67 
 
 
197 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  31.29 
 
 
190 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>