172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3449 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  100 
 
 		 122 aa  226  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  54.43 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  42.99 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  58.46 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  58.46 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  52.7 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2301  hypothetical protein  46.15 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  53.95 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  53.95 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  52.7 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  51.85 
 
 		 192 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  46.84 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  45 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  43.21 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  49.41 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  52.31 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  43.16 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  46.05 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  36.27 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  43.02 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  49.23 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  52.86 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  47.5 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  40.23 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  47.3 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  40.66 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  40.23 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  41.11 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  40.7 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  40.7 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  40.7 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  40.7 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  40.7 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  40.7 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  40.7 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  43.02 
 
 		 234 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  41.46 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  42.05 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  38.2 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  38.1 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  37.21 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  41.18 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  40.48 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  40.7 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  46.05 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0359  hypothetical protein  36.08 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0782  hypothetical protein  46.91 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.527529  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  41.18 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  38.55 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4686  hypothetical protein  36.05 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  40.7 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  41.46 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  41.46 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  38.64 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  40.7 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  40.74 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  41.3 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10411  hypothetical protein  35.05 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  hitchhiker  0.00106797 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  43.04 
 
 		 205 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0951  hypothetical protein  44.12 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  37.21 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  42.31 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  39.29 
 
 		 193 aa  57  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  40.48 
 
 		 206 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  40.51 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  39.53 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  39.53 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  35.71 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  39.53 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  45.12 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  39.76 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  40.24 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  40.24 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2416  hypothetical protein  42.53 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  47.95 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  38.37 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  39.29 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  39.24 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  42.42 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  39.24 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  36.05 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  39.53 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10201  hypothetical protein  40.85 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  37.5 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  39.53 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  39.53 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  35.37 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09251  hypothetical protein  52.38 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  37.8 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  38.46 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  40.51 
 
 		 194 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  35.96 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  37.8 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  38.64 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0914  hypothetical protein  39.02 
 
 		 184 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  38.46 
 
 		 197 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0051  protein of unknown function UPF0016  41.89 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  42.31 
 
 		 191 aa  53.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  37.8 
 
 		 198 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>