171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0951 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0951  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  206  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09251  hypothetical protein  74.07 
 
 
108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10201  hypothetical protein  87.96 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10191  hypothetical protein  87.96 
 
 
108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  47.17 
 
 
110 aa  114  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  51.04 
 
 
112 aa  111  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  52.04 
 
 
115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  52.04 
 
 
115 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  53.85 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  53.33 
 
 
94 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  43.16 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  48 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  46.32 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  46.07 
 
 
124 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  46.91 
 
 
126 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  46.91 
 
 
126 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  42.55 
 
 
121 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  45.56 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  45.57 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  57.38 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  50.59 
 
 
97 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  35.71 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  52.73 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  36.89 
 
 
192 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0359  hypothetical protein  44.44 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  49.23 
 
 
105 aa  62  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0051  protein of unknown function UPF0016  44.44 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10411  hypothetical protein  44.44 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  hitchhiker  0.00106797 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  34.41 
 
 
190 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  34.41 
 
 
190 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  34.41 
 
 
190 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  34.41 
 
 
190 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  34.41 
 
 
190 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  34.41 
 
 
190 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  34.41 
 
 
190 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  39.02 
 
 
90 aa  60.5  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  40.96 
 
 
185 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  40.96 
 
 
185 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  41.46 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  60 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  31.07 
 
 
194 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  33.7 
 
 
190 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10201  hypothetical protein  60 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  29.25 
 
 
194 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  40.24 
 
 
196 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  33.68 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  37.18 
 
 
194 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  32.26 
 
 
218 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  32 
 
 
192 aa  58.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  31.07 
 
 
194 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  32.26 
 
 
234 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  39.73 
 
 
221 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  35.9 
 
 
194 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  36.36 
 
 
190 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  35.9 
 
 
194 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  32.26 
 
 
218 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  33.71 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  35.48 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  32.26 
 
 
190 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  32.26 
 
 
218 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  32.26 
 
 
190 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  32.26 
 
 
218 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  30.39 
 
 
231 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  32.35 
 
 
191 aa  55.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  30.11 
 
 
190 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61260  hypothetical protein  37.18 
 
 
192 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5275  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.932867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  32.91 
 
 
186 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  35.14 
 
 
190 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  33.75 
 
 
199 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  27.36 
 
 
194 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  36.9 
 
 
219 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  29.89 
 
 
187 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3666  hypothetical protein  33.75 
 
 
194 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41250  hypothetical protein  34.62 
 
 
193 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396742  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  34.57 
 
 
188 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  25.96 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  33.33 
 
 
191 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  29 
 
 
270 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  29.7 
 
 
199 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  32.61 
 
 
195 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  37.18 
 
 
196 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  32.26 
 
 
192 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  29.67 
 
 
190 aa  51.2  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  26.8 
 
 
192 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  30.59 
 
 
205 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  38.27 
 
 
184 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  33.77 
 
 
204 aa  50.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  32.26 
 
 
192 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  36.59 
 
 
197 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  36.36 
 
 
184 aa  50.4  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  35.37 
 
 
197 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  38.55 
 
 
212 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  42.42 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  34.41 
 
 
207 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  33.33 
 
 
191 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  47.27 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  47.27 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  35.37 
 
 
198 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  32.89 
 
 
203 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>