93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3486 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  247  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  43.69 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  48.31 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  48.86 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  48.15 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  40.66 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  41.38 
 
 		 97 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  44.71 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0051  protein of unknown function UPF0016  46.58 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  40 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10201  hypothetical protein  47.89 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  46.48 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  47.3 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  49.33 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  42.53 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  42.53 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0359  hypothetical protein  42.39 
 
 		 98 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  41.67 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  38.89 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  38.89 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  47.76 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10411  hypothetical protein  41.3 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  hitchhiker  0.00106797 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  42.86 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  45.95 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  39.29 
 
 		 192 aa  53.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  34.94 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  33.03 
 
 		 132 aa  52  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  49.09 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  37.5 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  37.21 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  49.09 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  38.36 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2301  hypothetical protein  42.67 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  32.99 
 
 		 215 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  42.53 
 
 		 256 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  36.47 
 
 		 235 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  42.25 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  42.25 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  38.81 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  31.91 
 
 		 231 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  30 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0951  hypothetical protein  35 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  35.24 
 
 		 201 aa  48.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  40.45 
 
 		 261 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4686  hypothetical protein  37.84 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  36.05 
 
 		 216 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  35.29 
 
 		 235 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  35.29 
 
 		 235 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  27.27 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  40.26 
 
 		 196 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  33.73 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  37.84 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  35.14 
 
 		 190 aa  44.3  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  28.42 
 
 		 213 aa  44.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  37.84 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  38.36 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  35.62 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  41.54 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  38.36 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  36.49 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  35.62 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  34.72 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  29.51 
 
 		 235 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  37.65 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  38.36 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2416  hypothetical protein  41.1 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  37.84 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6052  predicted protein  28.09 
 
 		 218 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388708  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  39.53 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  32.58 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  38.27 
 
 		 185 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  26.37 
 
 		 219 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  41.6  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  35.29 
 
 		 204 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  35.62 
 
 		 187 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  32.93 
 
 		 212 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  32.94 
 
 		 195 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  36.71 
 
 		 204 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  35.06 
 
 		 234 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  41.51 
 
 		 360 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  34.21 
 
 		 205 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  34.62 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  34.62 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  34.62 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  34.62 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  34.62 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  34.62 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  34.62 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  32.1 
 
 		 233 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09241  hypothetical protein  35.85 
 
 		 75 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.607545  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  34.25 
 
 		 206 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>