160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1343 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  226  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  43.69 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  43.97 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  45.65 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  48.84 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  47.13 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  47.67 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  46.51 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  47.13 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  40.86 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  41.57 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  46.51 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0359  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  41.38 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  40.91 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0051  protein of unknown function UPF0016  47.22 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10201  hypothetical protein  48.72 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  48.72 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10411  hypothetical protein  48.84 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  hitchhiker  0.00106797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  37.78 
 
 		 235 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  37.78 
 
 		 235 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  37.78 
 
 		 235 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  45.33 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  44.3 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  40.45 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  46.58 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  38.2 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  39.51 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  42.86 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  43.66 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  37.5 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  46.27 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  46.27 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  39.24 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  39.24 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  34.48 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  40.54 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  41.67 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  38.64 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  32.71 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  34.88 
 
 		 188 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  35.29 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  41.18 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  35.23 
 
 		 197 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  30.93 
 
 		 196 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  41.18 
 
 		 196 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2301  hypothetical protein  33.71 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  32.91 
 
 		 189 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09251  hypothetical protein  42.68 
 
 		 108 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  40.24 
 
 		 195 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  35.06 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  41.33 
 
 		 191 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4686  hypothetical protein  34.48 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  31.71 
 
 		 194 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  36.36 
 
 		 204 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  38.96 
 
 		 206 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  39.29 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  37.66 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  37.33 
 
 		 204 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  37.04 
 
 		 233 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  30.21 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  33.33 
 
 		 238 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0951  hypothetical protein  42.25 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  35.71 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  36.59 
 
 		 207 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  28.85 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  30.21 
 
 		 235 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  33.33 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  33.73 
 
 		 194 aa  47.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  37.97 
 
 		 234 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  32.93 
 
 		 187 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  35.44 
 
 		 185 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  33.66 
 
 		 204 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  35 
 
 		 185 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  32.56 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  36.36 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  36.36 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  34.48 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  34.43 
 
 		 216 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  32.94 
 
 		 192 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  36.78 
 
 		 248 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  27.45 
 
 		 194 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  39.19 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  39.19 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2416  hypothetical protein  38.2 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  39.19 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  39.19 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  39.19 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  39.19 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  39.19 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3666  hypothetical protein  34.12 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  27.45 
 
 		 194 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  34.09 
 
 		 302 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6052  predicted protein  32.1 
 
 		 218 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388708  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  36.49 
 
 		 190 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  43.08 
 
 		 196 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  34.83 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  37.97 
 
 		 189 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>