149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_10201 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_10201  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  190  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  96.74 
 
 
103 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  90.91 
 
 
100 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  57.84 
 
 
121 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  59.41 
 
 
105 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  57.84 
 
 
105 aa  117  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09241  hypothetical protein  73.97 
 
 
75 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.607545  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  58.14 
 
 
97 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0359  hypothetical protein  60.44 
 
 
98 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10411  hypothetical protein  60.44 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  hitchhiker  0.00106797 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  42.42 
 
 
108 aa  85.1  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  49.35 
 
 
93 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  41.76 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  48.05 
 
 
93 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  52.38 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  44.79 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  47.13 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  45.24 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  47.13 
 
 
115 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  47.67 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  47.62 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  44.44 
 
 
90 aa  72.8  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  47.19 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  44.19 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2301  hypothetical protein  39 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  44.19 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  43.42 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4686  hypothetical protein  37.11 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  46.48 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2416  hypothetical protein  44.21 
 
 
95 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  60.78 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  60.78 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  44.16 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  37.21 
 
 
192 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  39.76 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0051  protein of unknown function UPF0016  47.06 
 
 
90 aa  61.6  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  47.69 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2379  hypothetical protein  44.9 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0164268 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  35.53 
 
 
185 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  33.72 
 
 
192 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0951  hypothetical protein  59.57 
 
 
108 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09251  hypothetical protein  56.67 
 
 
108 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  34.21 
 
 
185 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  33.68 
 
 
189 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  43.06 
 
 
205 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  38.46 
 
 
204 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  32.29 
 
 
270 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  39.73 
 
 
218 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  38.16 
 
 
196 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  32.99 
 
 
360 aa  50.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  37.8 
 
 
197 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  41.1 
 
 
216 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  35.53 
 
 
201 aa  50.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  41.1 
 
 
213 aa  50.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  39.19 
 
 
216 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04814  UPF0016 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07080)  32.1 
 
 
516 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0310386  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  43.1 
 
 
196 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  32.58 
 
 
195 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  29.55 
 
 
235 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  31.94 
 
 
186 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  28.05 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  28.05 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  33.7 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  28.05 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  28.05 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  28.05 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  28.05 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  28.05 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  30.53 
 
 
188 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  30.26 
 
 
234 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  36.99 
 
 
216 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  30.86 
 
 
204 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  29.87 
 
 
194 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  30.23 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  31.03 
 
 
206 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  32.89 
 
 
190 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  40.91 
 
 
238 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  28.05 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  38.36 
 
 
215 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  39.08 
 
 
235 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  28.05 
 
 
203 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  31.58 
 
 
191 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  29.27 
 
 
193 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  28.95 
 
 
196 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  34.67 
 
 
256 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  31.58 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  29.87 
 
 
194 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3202  hypothetical protein  27.27 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  30.86 
 
 
190 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  35.8 
 
 
231 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  28.41 
 
 
235 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  30.43 
 
 
196 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  28.41 
 
 
235 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  29.29 
 
 
187 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  29.33 
 
 
190 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  39.68 
 
 
221 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  30.26 
 
 
188 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>