120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2379 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2379  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  191  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0164268 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2416  hypothetical protein  84.21 
 
 
95 aa  127  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  58 
 
 
104 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2301  hypothetical protein  61.62 
 
 
99 aa  115  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  60.22 
 
 
93 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  59.14 
 
 
93 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  53 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4686  hypothetical protein  54.26 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  48.04 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  45.63 
 
 
105 aa  89.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  50.52 
 
 
121 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  45.98 
 
 
97 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  48.84 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  46.51 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10201  hypothetical protein  47.44 
 
 
102 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0359  hypothetical protein  42.11 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10411  hypothetical protein  42.11 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  hitchhiker  0.00106797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  40.74 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  40.54 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  37.21 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  42.86 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09241  hypothetical protein  41.89 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.607545  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  42.42 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  42.42 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  37.66 
 
 
234 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  36.71 
 
 
190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  36.71 
 
 
190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  39.24 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  36.71 
 
 
190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  36.71 
 
 
190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  36.71 
 
 
190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  36.71 
 
 
190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  36.71 
 
 
190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0051  protein of unknown function UPF0016  39.47 
 
 
90 aa  53.9  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  39.71 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  36.9 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  45.59 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  39.19 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  36.9 
 
 
185 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  35.44 
 
 
218 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  35.44 
 
 
190 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  35.44 
 
 
190 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  35.44 
 
 
218 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  35.44 
 
 
190 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  44.12 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  35.62 
 
 
203 aa  50.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  44.12 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  33.73 
 
 
190 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  35.06 
 
 
218 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  35.06 
 
 
218 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  40.91 
 
 
120 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  37.97 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  36.14 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  33.73 
 
 
191 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  35.44 
 
 
190 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1664  protein of unknown function UPF0016  31.87 
 
 
211 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  37.18 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  37.84 
 
 
115 aa  48.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  37.84 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  37.31 
 
 
186 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  37.68 
 
 
190 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  36.26 
 
 
248 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  33.78 
 
 
204 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  33.78 
 
 
194 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  32.43 
 
 
190 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  31.17 
 
 
196 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  34.18 
 
 
192 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  32.43 
 
 
194 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  33.78 
 
 
194 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0682  hypothetical protein  31.25 
 
 
184 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  32.88 
 
 
184 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  31.46 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  32.43 
 
 
190 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  29.73 
 
 
191 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  42.67 
 
 
205 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  31.25 
 
 
197 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  35.44 
 
 
192 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  32.43 
 
 
194 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  32.5 
 
 
184 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04814  UPF0016 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07080)  35.48 
 
 
516 aa  44.3  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0310386  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  30.86 
 
 
198 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  41.38 
 
 
196 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  32.32 
 
 
360 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3880  hypothetical protein  31.25 
 
 
188 aa  44.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000226161  hitchhiker  0.000000250469 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  30.77 
 
 
196 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  30.86 
 
 
198 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  32.39 
 
 
191 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  31.25 
 
 
204 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  35.16 
 
 
270 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  31.08 
 
 
194 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  34.94 
 
 
201 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  32.88 
 
 
197 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  29.63 
 
 
188 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  33.75 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  28.89 
 
 
188 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  33.75 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  33.75 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  27.06 
 
 
204 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  31.08 
 
 
194 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  32.65 
 
 
189 aa  42.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>