174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1316 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  209  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  91.3 
 
 		 112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  80.9 
 
 		 94 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  58.42 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  53.61 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  53.61 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09251  hypothetical protein  49.02 
 
 		 108 aa  97.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0951  hypothetical protein  47.17 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  52.27 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  64.79 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  64.79 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  53.01 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  47.31 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  51.11 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  47.31 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  57.89 
 
 		 124 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10191  hypothetical protein  51.95 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0051  protein of unknown function UPF0016  60 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10201  hypothetical protein  51.95 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  46.25 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  48.84 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  44.32 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  53.95 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10411  hypothetical protein  48.24 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  hitchhiker  0.00106797 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0359  hypothetical protein  47.06 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  45.35 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  45.05 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  45.68 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  46.15 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  44.19 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  46.58 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  42.53 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  33.98 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10201  hypothetical protein  42.86 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  42.31 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  41.76 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  44.93 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  41.46 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2301  hypothetical protein  42.86 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  32.88 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  36.84 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4686  hypothetical protein  40.26 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  35.05 
 
 		 238 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  31.87 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  31.87 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  32.69 
 
 		 196 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1438  protein of unknown function UPF0016  31.46 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  44.12 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  36.76 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  36.25 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  44.12 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  33 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  34.41 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  36.47 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  36.9 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  34 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  36.9 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  36.9 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  36.62 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  39.29 
 
 		 221 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  36.9 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  36.9 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  36.9 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  36.9 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  36.9 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  41.18 
 
 		 205 aa  53.9  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  32.97 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  38.04 
 
 		 235 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  37.37 
 
 		 195 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  38.54 
 
 		 199 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  35.9 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  32.97 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  32.97 
 
 		 218 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  33.7 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  32.97 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  37.33 
 
 		 194 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41250  hypothetical protein  39.29 
 
 		 193 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396742  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0914  hypothetical protein  32.26 
 
 		 184 aa  51.2  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  31.18 
 
 		 197 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  40.54 
 
 		 215 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  31.87 
 
 		 218 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0682  hypothetical protein  34.07 
 
 		 184 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  32.26 
 
 		 197 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  32.97 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3880  hypothetical protein  30.21 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000226161  hitchhiker  0.000000250469 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  34.12 
 
 		 218 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  34.12 
 
 		 218 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  36.71 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  33.7 
 
 		 194 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  32.69 
 
 		 193 aa  50.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  31.18 
 
 		 198 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  31.18 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  31.18 
 
 		 198 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  33.7 
 
 		 194 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  35.8 
 
 		 203 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  29.03 
 
 		 189 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  36.96 
 
 		 235 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>