163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_10201 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_10201  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  207  4e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0951  hypothetical protein  87.96 
 
 
108 aa  164  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10191  hypothetical protein  96.3 
 
 
108 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09251  hypothetical protein  71.3 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  49.53 
 
 
115 aa  117  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  49.53 
 
 
115 aa  117  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  47.17 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  47.92 
 
 
112 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  53.92 
 
 
120 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  51.11 
 
 
94 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  47.52 
 
 
132 aa  100  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  40 
 
 
115 aa  98.2  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  47.12 
 
 
138 aa  98.2  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  48.15 
 
 
126 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  48.15 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  43.16 
 
 
124 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  42.27 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  43.27 
 
 
151 aa  87  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  43.21 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  48.53 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  48.31 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  48.53 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  55 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0051  protein of unknown function UPF0016  43.06 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0359  hypothetical protein  42.53 
 
 
98 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  36.63 
 
 
192 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  41.46 
 
 
196 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  41.67 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10411  hypothetical protein  41.38 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  hitchhiker  0.00106797 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  46.43 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  34.88 
 
 
192 aa  60.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  31.73 
 
 
194 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  31.07 
 
 
194 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  58 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  31.07 
 
 
194 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  40 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  30.77 
 
 
194 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10201  hypothetical protein  58 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  31.91 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  31.58 
 
 
188 aa  57.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  34.15 
 
 
190 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  34.15 
 
 
190 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  34.15 
 
 
190 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  34.15 
 
 
190 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  34.15 
 
 
190 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  34.15 
 
 
190 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  34.15 
 
 
190 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  34.83 
 
 
221 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  38.55 
 
 
185 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61260  hypothetical protein  37.18 
 
 
192 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  38.55 
 
 
185 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  35.14 
 
 
190 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5275  hypothetical protein  35.9 
 
 
192 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.932867  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  37.66 
 
 
194 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  32.93 
 
 
190 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  32.5 
 
 
190 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  30.61 
 
 
187 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  32.93 
 
 
234 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  36.36 
 
 
194 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  30.61 
 
 
205 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  32.93 
 
 
218 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  32.93 
 
 
218 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  29.41 
 
 
191 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  26 
 
 
188 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  34.78 
 
 
126 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  30.38 
 
 
186 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  32.93 
 
 
190 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  32.93 
 
 
190 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  33.77 
 
 
190 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  32.93 
 
 
218 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  32.93 
 
 
218 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  32.5 
 
 
199 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3666  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41250  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396742  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  31.71 
 
 
203 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  41.18 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  31.13 
 
 
194 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  24.04 
 
 
189 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4713  hypothetical protein  27.36 
 
 
194 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133421  normal  0.150702 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  27.45 
 
 
231 aa  51.2  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  32.56 
 
 
219 aa  50.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  32.05 
 
 
191 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  31.71 
 
 
191 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  32.65 
 
 
188 aa  50.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  28.57 
 
 
190 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  34.34 
 
 
207 aa  50.1  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  41.79 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  41.79 
 
 
93 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  30.68 
 
 
270 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  33.98 
 
 
233 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  34.62 
 
 
196 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  30.53 
 
 
186 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  35.06 
 
 
184 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  33.68 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  29.13 
 
 
185 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  31 
 
 
198 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  31 
 
 
198 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  35.37 
 
 
197 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  31.25 
 
 
192 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  28.42 
 
 
204 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>