175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_10411 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_10411  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  hitchhiker  0.00106797 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0359  hypothetical protein  97.96 
 
 
98 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  58.42 
 
 
121 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  60.44 
 
 
103 aa  105  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  55 
 
 
105 aa  104  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  60.92 
 
 
105 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  55.29 
 
 
97 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10201  hypothetical protein  60.76 
 
 
102 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  55.68 
 
 
100 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  54.12 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  53.49 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1316  hypothetical protein  48.24 
 
 
110 aa  82  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14491  hypothetical protein  47.06 
 
 
94 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1159  hypothetical protein  47.06 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.117788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  43.75 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  40 
 
 
108 aa  77.8  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  45.65 
 
 
93 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  45.65 
 
 
93 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  48.84 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  47.44 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09241  hypothetical protein  51.43 
 
 
75 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.607545  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3449  protein of unknown function UPF0016  35.05 
 
 
122 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0236058 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  41.98 
 
 
90 aa  68.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  40.7 
 
 
192 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  43.02 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  40.24 
 
 
192 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2301  hypothetical protein  38.38 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  41.3 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4686  hypothetical protein  41.49 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  44 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1114  protein of unknown function UPF0016  50.82 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1085  protein of unknown function UPF0016  50.82 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2538  protein of unknown function UPF0016  40.51 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2416  hypothetical protein  44.79 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0051  protein of unknown function UPF0016  45.07 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4685  protein of unknown function UPF0016  41.18 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0951  hypothetical protein  44.12 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  40 
 
 
185 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  38.96 
 
 
186 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  44.44 
 
 
205 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  37.5 
 
 
203 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  39.74 
 
 
190 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2379  hypothetical protein  42.11 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0164268 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  36.84 
 
 
204 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  40.85 
 
 
201 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  35.37 
 
 
195 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  38.27 
 
 
193 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  35.29 
 
 
204 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  43.1 
 
 
196 aa  53.9  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  38.67 
 
 
185 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  33.75 
 
 
196 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  40.28 
 
 
221 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  39.53 
 
 
270 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09251  hypothetical protein  44.59 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  37.33 
 
 
256 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  39.24 
 
 
216 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  35.44 
 
 
234 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  34.67 
 
 
190 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  34.67 
 
 
190 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3202  hypothetical protein  36 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  34.67 
 
 
190 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  34.67 
 
 
190 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  34.67 
 
 
190 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  34.67 
 
 
190 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  34.67 
 
 
190 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  37.93 
 
 
206 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  38.67 
 
 
191 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  35.14 
 
 
190 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  40 
 
 
188 aa  50.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  35.53 
 
 
190 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04814  UPF0016 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07080)  34.41 
 
 
516 aa  49.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0310386  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  34.21 
 
 
192 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  39.74 
 
 
215 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  31.71 
 
 
191 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  39.74 
 
 
218 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  34.67 
 
 
196 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  35.44 
 
 
190 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0760  hypothetical protein  35.53 
 
 
194 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  34.21 
 
 
194 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  34.18 
 
 
196 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  33.78 
 
 
190 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0788  hypothetical protein  35.53 
 
 
194 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.632611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  34.15 
 
 
241 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  32.91 
 
 
218 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  32.91 
 
 
218 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  39.24 
 
 
216 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  34.21 
 
 
190 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4428  hypothetical protein  35.53 
 
 
194 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2409  hypothetical protein  35.71 
 
 
183 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.936736  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  35 
 
 
184 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  34.21 
 
 
188 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  32.65 
 
 
248 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  35.8 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  32.89 
 
 
192 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  32.43 
 
 
190 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  32.93 
 
 
190 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  32.43 
 
 
218 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>