22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_09241 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_09241  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.607545  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0952  hypothetical protein  72.6 
 
 
100 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10201  hypothetical protein  80.65 
 
 
102 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10211  hypothetical protein  80.65 
 
 
103 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1315  hypothetical protein  52.05 
 
 
105 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.159304 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1160  hypothetical protein  60.34 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194898  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09141  hypothetical protein  51.52 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  hitchhiker  0.00000889165 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14481  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0359  hypothetical protein  52.31 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10411  hypothetical protein  52.31 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.138665  hitchhiker  0.00106797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1115  protein of unknown function UPF0016  40 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2537  protein of unknown function UPF0016  44.83 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0591  membrane protein-like  36.62 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0615374  normal  0.537899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1086  protein of unknown function UPF0016  38.46 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  39.39 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2301  hypothetical protein  36.67 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  40 
 
 
90 aa  44.3  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1343  hypothetical protein  44.44 
 
 
116 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09131  hypothetical protein  38.46 
 
 
120 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.319051  hitchhiker  0.00000904794 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  36.51 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3486  hypothetical protein  35.85 
 
 
126 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  36.51 
 
 
115 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>