178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2416 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  393  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  62.29 
 
 		 201 aa  204  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  46.47 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  42.69 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  40.11 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  42.77 
 
 		 192 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  39.43 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  34.5 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0782  hypothetical protein  43.43 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.527529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  37.57 
 
 		 186 aa  86.3  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  35.71 
 
 		 185 aa  85.5  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  34.18 
 
 		 360 aa  85.1  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  34.74 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  34.76 
 
 		 270 aa  81.6  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  34.91 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  36.25 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  35.4 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  37.7 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  35.06 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  35.06 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  35.06 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  35.06 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  33.14 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  35.59 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  35.59 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  35.59 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  35.59 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  35.59 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  35.59 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  35.59 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  31.79 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  30.05 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  35.03 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  35.85 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  32.48 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  31.98 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  33.75 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  33.53 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  34.1 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  33.77 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  32.37 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4337  hypothetical protein  30.68 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3028  hypothetical protein  35.75 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.521433 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0946  hypothetical protein  35.75 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0909  hypothetical protein  35.75 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0121906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1071  hypothetical protein  35.2 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  31.58 
 
 		 187 aa  72  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  29.83 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3189  hypothetical protein  32 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.372005  normal  0.740442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  32.76 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  34.21 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  32.07 
 
 		 261 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41260  hypothetical protein  30.46 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140731  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  33.15 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  35.22 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  32.77 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  33.33 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  30.11 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  29.12 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0241  hypothetical protein  31.25 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  32.77 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  32.77 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  32.77 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  29.41 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  32.63 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  32.18 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0914  hypothetical protein  35.06 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2497  hypothetical protein  31.87 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  32.81 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  29.14 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  31.79 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  31.79 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  29.73 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  30.81 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  32.81 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  28.41 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  31.67 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0447  hypothetical protein  27.81 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.243135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  34.18 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00451  hypothetical protein  29.12 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  31.76 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  29.94 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  28.57 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  40.5 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001996  hypothetical protein  28.02 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  40.5 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  32.05 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  28.57 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  30.68 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0887  hypothetical protein  29.71 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159087  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  29.65 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0985  hypothetical protein  31.32 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  29.82 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1998  hypothetical protein  32.12 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.579109  normal  0.0445396 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  30.32 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  31.87 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  31.43 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  31.72 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2940  hypothetical protein  34.25 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.835594  normal  0.0290979 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  30.46 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>