22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2025 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2025  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0015  hypothetical protein  60.24 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.749123  normal  0.735354 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1965  hypothetical protein  59.34 
 
 		 247 aa  262  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.525919  normal  0.107864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  30 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  26.42 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  31.06 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  27.78 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  30 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  26.86 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  26.13 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  29.89 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  27.43 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  27.07 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  25.64 
 
 		 196 aa  48.5  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  27.03 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  26.22 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  25.86 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  27.86 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  25.93 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  24.39 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  31.16 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  23.71 
 
 		 187 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>