133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2616 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6418  protein of unknown function UPF0016  46.8 
 
 		 198 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00518335  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  42.41 
 
 		 360 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  43.06 
 
 		 270 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  41.71 
 
 		 199 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0022  protein of unknown function UPF0016  51.93 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  41.87 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  44.26 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0157  protein of unknown function UPF0016  42.5 
 
 		 205 aa  96.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  37.5 
 
 		 192 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  38.14 
 
 		 192 aa  92  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  36.22 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  61.04 
 
 		 248 aa  85.5  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  36.11 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  40.43 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  33.7 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  37.08 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  34.97 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  33.52 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  36.17 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2016  hypothetical protein  37.99 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  31.15 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  30.81 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4708  hypothetical protein  35.45 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.667531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  31.84 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  26.92 
 
 		 190 aa  62  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  29.47 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  28.34 
 
 		 185 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2072  hypothetical protein  30.48 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0921348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  32.57 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  30.21 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  31.35 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  28.34 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0520  hypothetical protein  32.75 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  33.71 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  33.71 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4103  hypothetical protein  30.94 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217068 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  33.71 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  33.71 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  33.71 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  33.71 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  33.71 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  31.89 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  33.52 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  33.15 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3626  hypothetical protein  30.16 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  29.21 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0395  hypothetical protein  34.64 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000330292  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2025  hypothetical protein  31.06 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  32.2 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4126  hypothetical protein  32.43 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  33.7 
 
 		 302 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3484  protein of unknown function UPF0016  32.43 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0015  hypothetical protein  30.65 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.749123  normal  0.735354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2039  protein of unknown function UPF0016  31.67 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589069  hitchhiker  0.00000000898807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  32.2 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4779  hypothetical protein  30.39 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  32.35 
 
 		 189 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  30.22 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  30.41 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  30.04 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  35.16 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1056  hypothetical protein  30.37 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  35.26 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3536  protein of unknown function UPF0016  32.45 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  31.94 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  28.25 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  32.47 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  31.46 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  28.96 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  35.66 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1416  protein of unknown function UPF0016  33.77 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000085126  normal  0.0435338 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0667  hypothetical protein  28.11 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  31.98 
 
 		 185 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  28.32 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  31.43 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  34.51 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  30.05 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  24.44 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  32.07 
 
 		 195 aa  52  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  31.61 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  28.04 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1430  hypothetical protein  22.04 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000236998  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  30.11 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  31.61 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1998  hypothetical protein  32.56 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.579109  normal  0.0445396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4890  hypothetical protein  30.99 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1965  hypothetical protein  27.94 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.525919  normal  0.107864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1145  hypothetical protein  32.24 
 
 		 194 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2663  hypothetical protein  32.14 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  28.73 
 
 		 184 aa  49.7  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31737  predicted protein  29.52 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5289  protein of unknown function UPF0016  31.61 
 
 		 187 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0802  hypothetical protein  31.41 
 
 		 194 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1084  protein of unknown function UPF0016  27.37 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  33.52 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  33.15 
 
 		 220 aa  48.9  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  30.11 
 
 		 193 aa  48.9  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1080  membrane protein  28.57 
 
 		 189 aa  48.5  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>