107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0157 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0157  protein of unknown function UPF0016  100 
 
 		 205 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0167  hypothetical protein  53.09 
 
 		 196 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0262  protein of unknown function UPF0016  54.82 
 
 		 199 aa  167  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4726  protein of unknown function UPF0016  47.47 
 
 		 270 aa  128  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6459  hypothetical protein  42.78 
 
 		 360 aa  124  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2616  hypothetical protein  42.5 
 
 		 239 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01050  predicted membrane protein  44.21 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6418  protein of unknown function UPF0016  38.58 
 
 		 198 aa  111  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00518335  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0857  hypothetical protein  37.88 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000443477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1157  hypothetical protein  35 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000108127  hitchhiker  0.0070658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0022  protein of unknown function UPF0016  40 
 
 		 198 aa  85.5  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6182  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.526901  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1174  hypothetical protein  34.59 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0854638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0551  protein of unknown function UPF0016  32.49 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000259464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1416  protein of unknown function UPF0016  31.5 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000085126  normal  0.0435338 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_6595  predicted protein  34.9 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2513  hypothetical protein  32.24 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0274541  normal  0.55837 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2812  hypothetical protein  25.25 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0442217  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31737  predicted protein  30.85 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2378  hypothetical protein  33.16 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0488  hypothetical protein  35.06 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0094  hypothetical protein  30.85 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2260  hypothetical protein  34.87 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12265  predicted protein  30.43 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0360  hypothetical protein  34.06 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0667  hypothetical protein  25 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.142799  normal  0.0573866 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0533  hypothetical protein  33.92 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0745  hypothetical protein  31.18 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0996219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0973  protein of unknown function UPF0016  33.72 
 
 		 90 aa  53.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000116489  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0516  protein of unknown function UPF0016  34.48 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113311  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1990  hypothetical protein  32.24 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2100  hypothetical protein  29.19 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.636196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2117  hypothetical protein  37.36 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0782  hypothetical protein  34.47 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.527529  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0892  hypothetical protein  32.09 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0880  hypothetical protein  32.09 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1017  hypothetical protein  32.09 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1237  protein of unknown function UPF0016  35.29 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0933  hypothetical protein  30.73 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413996  normal  0.753002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4128  hypothetical protein  31.55 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0925  hypothetical protein  31.84 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0538  hypothetical protein  32.09 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0976  hypothetical protein  32.62 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2302  hypothetical protein  38.61 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0366  putative transmembrane protein  32.43 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5425  hypothetical protein  32.7 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.441557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0688  hypothetical protein  31.55 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1390  protein of unknown function UPF0016  27.84 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.023314  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0521  protein of unknown function UPF0016  34.48 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1345  protein of unknown function UPF0016  32.56 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6052  predicted protein  26.67 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.388708  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0464  hypothetical protein  30.65 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00884521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3026  hypothetical protein  30.65 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.754775  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0327  hypothetical protein  27.66 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1312  hypothetical protein  31.76 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2611  hypothetical protein  30.65 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0983  hypothetical protein  30.65 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2920  hypothetical protein  30.65 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2980  hypothetical protein  30.65 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0164  hypothetical protein  30.65 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549532  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0125  protein of unknown function UPF0016  30.18 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0237504  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2431  transmembrane protein  31.05 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447861  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13884  transmembrane protein  30.18 
 
 		 302 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1137  protein of unknown function UPF0016  24.14 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.562577  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1609  hypothetical protein  30.11 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0895  hypothetical protein  28.72 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.363973  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15159  predicted protein  27.23 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000205164  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2778  hypothetical protein  31.16 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3467  hypothetical protein  28.72 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950509  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6045  hypothetical protein  30.81 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2448  protein of unknown function UPF0016  33.17 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2378  hypothetical protein  32.94 
 
 		 138 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5046  hypothetical protein  32.08 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5134  hypothetical protein  32.08 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0853146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2416  hypothetical protein  31.32 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2248  hypothetical protein  29.84 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.35774  normal  0.686727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0575  hypothetical protein  29.69 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0148  hypothetical protein  30.61 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3590  hypothetical protein  28.72 
 
 		 184 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.976053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3391  protein of unknown function UPF0016  28.72 
 
 		 184 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1610  hypothetical protein  25.93 
 
 		 185 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1386  hypothetical protein  25.93 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2417  hypothetical protein  31.18 
 
 		 132 aa  45.1  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0794  hypothetical protein  27.68 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3939  hypothetical protein  27.04 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143914  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5105  protein of unknown function UPF0016  31.95 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440587 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0590  membrane protein-like  45.76 
 
 		 115 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0431355  normal  0.533065 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0682  hypothetical protein  29.38 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7690  predicted protein  30.2 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.113136  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2251  protein of unknown function UPF0016  27.43 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0093  hypothetical protein  33.12 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10240  predicted membrane protein  29.17 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0577  hypothetical protein  28.49 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.188553  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1927  protein of unknown function UPF0016  27.17 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14267  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0155  protein of unknown function UPF0016  39.19 
 
 		 238 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.915442  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0115  hypothetical protein  28.35 
 
 		 189 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.454945  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0640  hypothetical protein  26.67 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10401  hypothetical protein  33.72 
 
 		 115 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88595  hitchhiker  0.0010839 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0358  hypothetical protein  33.72 
 
 		 115 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.42215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1560  membrane protein-like protein  29.1 
 
 		 190 aa  42  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00722707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>