More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66106 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_66106  Protein with similarity to DNA-binding region of heat shock transcription factors  100 
 
 
421 aa  873    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.415841  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03688  Stress response regulator SrrA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J0P7]  62.26 
 
 
558 aa  156  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01750  transcription factor, putative  52.99 
 
 
1028 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40 
 
 
631 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
902 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  36.46 
 
 
1014 aa  97.4  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 
984 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 
1009 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0191  histidine kinase  40.35 
 
 
531 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  35.94 
 
 
900 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 
964 aa  94.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00120  heat shock transcription factor 2, putative  43.14 
 
 
783 aa  93.2  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000900604  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3089  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  37.12 
 
 
856 aa  93.2  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3839  histidine kinase  35.25 
 
 
590 aa  92.8  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  41.03 
 
 
651 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 
912 aa  92  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2938  two component signal transduction response regulator  41.67 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.03674e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  37.6 
 
 
571 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1933  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
650 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77937  normal  0.846715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 
764 aa  91.3  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 
1202 aa  91.3  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.76 
 
 
818 aa  90.5  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 
928 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1596 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2324  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
1162 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  39.82 
 
 
647 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  35.88 
 
 
606 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_16323  Heat shock transcription factor  44 
 
 
599 aa  89.7  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.173191  normal  0.0871257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
916 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  28.33 
 
 
651 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
784 aa  88.2  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  37.6 
 
 
559 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4576  histidine kinase  37.07 
 
 
678 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.354871 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 
1222 aa  87.4  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.18 
 
 
2213 aa  87  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  37.01 
 
 
661 aa  87  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07851  hybrid sensory kinase  37.96 
 
 
730 aa  86.7  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
1266 aa  86.7  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  34.38 
 
 
727 aa  86.7  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
873 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
873 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1079  CBS sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
512 aa  86.3  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.721589  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  36.09 
 
 
1021 aa  86.7  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.67 
 
 
1499 aa  86.3  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 
1064 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  40.16 
 
 
1560 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
772 aa  86.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  39.37 
 
 
1686 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  34.07 
 
 
833 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1182 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 
1324 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000343468  normal  0.0609683 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  32.47 
 
 
1133 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  42.61 
 
 
779 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 
1350 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.96 
 
 
235 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  35.82 
 
 
786 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0472  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
517 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723652 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
785 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 
926 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
1128 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3548  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 
1681 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  43.48 
 
 
786 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 
791 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08035  hypothetical protein similar to heat shock transcription factor 2 (Broad)  32.31 
 
 
798 aa  84.3  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.747399 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05296  Two-component system protein A (EC 2.7.13.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P896]  40.65 
 
 
682 aa  84.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3783  histidine kinase  42.73 
 
 
737 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18481  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.76 
 
 
781 aa  84.7  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  35.71 
 
 
778 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
1240 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 
1681 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0229  histidine kinase  35.09 
 
 
724 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0610831  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 
1005 aa  84  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3174  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
1087 aa  84  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134389 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
866 aa  84  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01227  two-component hybrid sensor and regulator  37.01 
 
 
699 aa  84  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
873 aa  83.6  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  41.88 
 
 
1331 aa  84  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  35.48 
 
 
785 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44029  predicted protein  30.5 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.492048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 
631 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
1135 aa  83.6  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  39.32 
 
 
1023 aa  83.6  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0298  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 
899 aa  83.6  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0542846  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.54 
 
 
929 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  36.44 
 
 
1028 aa  83.2  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
899 aa  83.2  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.618287  normal  0.57938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
946 aa  83.2  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1627  histidine kinase  36.92 
 
 
538 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
1237 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  32.45 
 
 
1297 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
643 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  40.16 
 
 
783 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.19 
 
 
789 aa  82.8  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
1245 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 
1767 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  40.17 
 
 
955 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
876 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 
1003 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
818 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
572 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>