More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG01750 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG01750  transcription factor, putative  100 
 
 
1028 aa  2114    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03688  Stress response regulator SrrA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J0P7]  49.63 
 
 
558 aa  145  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66106  Protein with similarity to DNA-binding region of heat shock transcription factors  52.99 
 
 
421 aa  132  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.415841  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  33.66 
 
 
1028 aa  98.6  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3839  histidine kinase  37.93 
 
 
590 aa  90.9  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1674  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 
890 aa  89.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00434081  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  27.11 
 
 
676 aa  88.2  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.55 
 
 
1499 aa  88.6  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1079  CBS sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
512 aa  87.8  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.721589  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
772 aa  87  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4574  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 
729 aa  87.4  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.543152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
1009 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 
765 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  38.26 
 
 
785 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  38.26 
 
 
785 aa  86.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  38.26 
 
 
785 aa  86.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  38.26 
 
 
785 aa  85.9  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4576  histidine kinase  29.15 
 
 
678 aa  85.9  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.354871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0191  histidine kinase  32.26 
 
 
531 aa  85.5  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  39.66 
 
 
786 aa  85.5  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  38.79 
 
 
779 aa  85.1  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  34.88 
 
 
900 aa  84.7  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
835 aa  84.7  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  29.96 
 
 
645 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
984 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3783  histidine kinase  32.64 
 
 
737 aa  84.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  30.39 
 
 
661 aa  84  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3089  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  38.66 
 
 
856 aa  84.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
1057 aa  83.2  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 
1240 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 
1407 aa  83.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  38.66 
 
 
783 aa  83.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  31.22 
 
 
853 aa  82.8  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  38.14 
 
 
833 aa  82.8  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.79 
 
 
796 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  36.36 
 
 
1014 aa  82.4  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  33.5 
 
 
544 aa  82.4  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 
1792 aa  82  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  30.96 
 
 
651 aa  81.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 
1284 aa  81.6  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1933  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 
650 aa  81.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77937  normal  0.846715 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  31.91 
 
 
571 aa  81.6  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
695 aa  81.6  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 
1784 aa  81.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
1363 aa  81.3  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 
789 aa  81.3  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  38.46 
 
 
847 aa  81.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  40.17 
 
 
641 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 
1005 aa  80.5  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 
1182 aa  80.9  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
1786 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  37.07 
 
 
778 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
859 aa  80.9  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 
926 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
1782 aa  81.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
912 aa  81.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1360  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 
644 aa  79.7  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.528402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  40.68 
 
 
1765 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  33.33 
 
 
787 aa  79.7  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1187  two component system histidine kinase  30.23 
 
 
683 aa  80.1  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.572633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  35.34 
 
 
1023 aa  80.1  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.89 
 
 
858 aa  80.1  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 
860 aa  80.1  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1721  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 
869 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 
888 aa  80.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.408662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
1110 aa  80.1  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
863 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
784 aa  80.1  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0844  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  30.23 
 
 
669 aa  80.1  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.644717  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2964  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 
647 aa  80.1  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.45 
 
 
922 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0305  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
967 aa  79.3  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  unclonable  0.00000133293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  31.44 
 
 
729 aa  79.7  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
873 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1911  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 
787 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0413731  normal  0.503462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
764 aa  79.7  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  36.36 
 
 
559 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 
1691 aa  79.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
1767 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1546  histidine kinase  36.84 
 
 
545 aa  79  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 
1064 aa  79.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 
818 aa  79  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.5 
 
 
655 aa  79  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
1055 aa  79  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.11 
 
 
1596 aa  79  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
524 aa  78.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
1040 aa  79  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 
1222 aa  78.6  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 
1767 aa  79  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 
1767 aa  79  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 
589 aa  79  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0113735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 
1771 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0472  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
517 aa  78.6  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723652 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 
1245 aa  78.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  31.79 
 
 
917 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
687 aa  78.6  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
876 aa  78.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.92 
 
 
917 aa  78.2  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1070 aa  78.2  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0522  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
125 aa  78.2  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>