More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53846 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_53846  1-Acyl dihydroxyacetone phosphate reductase ribitol 2-dehydrogenase  100 
 
 		 291 aa  600  1e-170  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54648  1-Acyl dihydroxyacetone phosphate reductase  41.73 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.329924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85576  1-acyl dihydroxyacetone phosphate reductase  42.14 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.764393  hitchhiker  0.00283469 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.99 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05379  conserved hypothetical protein  31 
 
 		 365 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.228242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  34.13 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10399  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03370)  34.8 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.94715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37020  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  38.33 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1156  short chain dehydrogenase  30.83 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1053  short chain dehydrogenase  31.92 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 317 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03276  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G14460)  32.25 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0176594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3006  short chain dehydrogenase  35.78 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.662258  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10875  short chain dehydrogenase/reductase (Ayr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04530)  33.05 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  34.98 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 		 338 aa  108  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 		 269 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.27 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.16 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  33.99 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.45 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  30.28 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0206025  normal  0.910086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  30.55 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 260 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  29.82 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6077  oxidoreductase  36.46 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00216  conserved hypothetical protein  37.89 
 
 		 359 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110281  normal  0.352442 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5800  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.820059  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3866  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13680  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.995121 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  34.02 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4503  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.15 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1225  short chain dehydrogenase  32.09 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0559  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0552  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0613  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0569  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0554  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1694  short-chain dehydrogenase/reductase  36.32 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  31.11 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  31.5 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0407842  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1347  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 258 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.371645 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 276 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4006  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3022  short chain dehydrogenase  34.16 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.515629  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.18 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  29.09 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 		 265 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3029  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1270  short chain dehydrogenase  34.16 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3160  short chain dehydrogenase  34.16 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140307  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7375  ribitol 2-dehydrogenase  33.33 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  29.82 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  30.85 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0945  short chain dehydrogenase  30.51 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0967  short chain dehydrogenase  34.31 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  31 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  29.59 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  34.57 
 
 		 276 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  34.24 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  30.85 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 242 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.88898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 		 286 aa  99.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 281 aa  99.4  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  36.92 
 
 		 265 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3704  ribitol 2-dehydrogenase  32.62 
 
 		 242 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0194179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 		 256 aa  99  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  28.51 
 
 		 291 aa  99  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  36.72 
 
 		 847 aa  99  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 		 242 aa  99  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.432228  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0220  putative oxidoreductase NAD-/NADP-dependent  34.2 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  33.49 
 
 		 277 aa  99  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0572  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 		 269 aa  99  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0597  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 		 269 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.853747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>