More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10524 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_10524  predicted protein  100 
 
 		 256 aa  510  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.06 
 
 		 637 aa  256  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698046  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  54.25 
 
 		 627 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  55.06 
 
 		 628 aa  255  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  55.06 
 
 		 628 aa  255  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  55.06 
 
 		 628 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  55.06 
 
 		 632 aa  255  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.06 
 
 		 628 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.06 
 
 		 631 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  55.06 
 
 		 628 aa  255  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  55.06 
 
 		 628 aa  255  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.06 
 
 		 631 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.06 
 
 		 628 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.06 
 
 		 631 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.66 
 
 		 629 aa  255  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  55.06 
 
 		 628 aa  255  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.06 
 
 		 627 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.06 
 
 		 631 aa  255  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.06 
 
 		 631 aa  255  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  54.66 
 
 		 629 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.12 
 
 		 643 aa  254  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.66 
 
 		 629 aa  254  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.85 
 
 		 633 aa  254  8e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.85 
 
 		 633 aa  254  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.91 
 
 		 647 aa  254  9e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.06 
 
 		 621 aa  254  9e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0690  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.25 
 
 		 631 aa  254  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.827702  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.25 
 
 		 649 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.85 
 
 		 633 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.85 
 
 		 628 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  53.12 
 
 		 649 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  54.3 
 
 		 639 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  54.3 
 
 		 639 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.85 
 
 		 628 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  53.85 
 
 		 628 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.85 
 
 		 638 aa  253  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.12 
 
 		 657 aa  252  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.12 
 
 		 657 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.25 
 
 		 621 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.73 
 
 		 652 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.12 
 
 		 657 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.73 
 
 		 657 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.73 
 
 		 657 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.73 
 
 		 657 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.73 
 
 		 657 aa  251  6e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0592  cell division protein FtsH  54.03 
 
 		 660 aa  251  8.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000468831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.34 
 
 		 635 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.66 
 
 		 640 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.12 
 
 		 656 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  52.63 
 
 		 635 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.66 
 
 		 633 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.56 
 
 		 639 aa  250  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.12 
 
 		 657 aa  250  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.85 
 
 		 605 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  51.56 
 
 		 633 aa  249  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  51.56 
 
 		 633 aa  249  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  51.56 
 
 		 633 aa  249  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  51.56 
 
 		 633 aa  249  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3415  FtsH-2 peptidase  53.85 
 
 		 627 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  51.56 
 
 		 633 aa  249  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  51.56 
 
 		 633 aa  249  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  52.34 
 
 		 650 aa  250  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  53.85 
 
 		 605 aa  249  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.25 
 
 		 624 aa  249  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  51.56 
 
 		 633 aa  249  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.34 
 
 		 632 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.38 
 
 		 639 aa  249  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  53.04 
 
 		 618 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  52.73 
 
 		 659 aa  250  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.73 
 
 		 655 aa  249  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.12 
 
 		 651 aa  249  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  51.95 
 
 		 651 aa  249  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  52.34 
 
 		 650 aa  249  4e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  52.34 
 
 		 647 aa  249  4e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.12 
 
 		 650 aa  249  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.44 
 
 		 641 aa  249  5e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.63 
 
 		 642 aa  248  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.44 
 
 		 643 aa  248  6e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.44 
 
 		 634 aa  248  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.34 
 
 		 657 aa  248  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.41 
 
 		 687 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.04 
 
 		 640 aa  248  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.34 
 
 		 656 aa  248  9e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.63 
 
 		 638 aa  248  9e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.04 
 
 		 640 aa  248  9e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.23 
 
 		 642 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  51.56 
 
 		 647 aa  247  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  53.66 
 
 		 658 aa  248  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.04 
 
 		 634 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.23 
 
 		 640 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.44 
 
 		 640 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  50.78 
 
 		 633 aa  247  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.23 
 
 		 642 aa  247  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.04 
 
 		 640 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  51.56 
 
 		 644 aa  247  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  50.78 
 
 		 633 aa  246  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.63 
 
 		 635 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.63 
 
 		 635 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  52.63 
 
 		 635 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.63 
 
 		 638 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>