146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50961 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_50961  predicted protein  100 
 
 		 357 aa  733    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0280626  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13123  predicted protein  53.27 
 
 		 328 aa  360  3e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46874  predicted protein  45.76 
 
 		 396 aa  295  7e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183113  normal  0.846713 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06207  pyruvate dehydrogenase kinase (AFU_orthologue; AFUA_2G11900)  40.78 
 
 		 405 aa  263  4.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0955633  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00360  hypothetical protein  44.13 
 
 		 462 aa  238  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04400  kinase, putative  44.53 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90317  predicted protein  37.66 
 
 		 517 aa  207  3e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15081  predicted protein  32.97 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_09461  pyruvate dehydrogenase kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03240)  29.92 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10800  mitochondrial pyruvate dehydrogenase kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13600)  28.61 
 
 		 483 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.403507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29203  probable pyruvate dehydrogenase kinase  26.34 
 
 		 517 aa  130  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0107384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46264  predicted protein  26.95 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28836  predicted protein  23.1 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.640365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 		 752 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 612 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 682 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  30.88 
 
 		 659 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  26.92 
 
 		 785 aa  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.31 
 
 		 515 aa  49.7  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0963  histidine kinase  28.08 
 
 		 737 aa  49.7  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1222  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 686 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583301 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  29.23 
 
 		 470 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 498 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 679 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  28.08 
 
 		 1744 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0794  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00933158  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.05 
 
 		 1795 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4312  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 		 591 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26810  putative two-component sensor  25.14 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5165  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 		 593 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0361  histidine kinase  26.47 
 
 		 468 aa  47.4  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000148321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  31.11 
 
 		 391 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0375  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 494 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 621 aa  47  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  27.06 
 
 		 661 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 		 827 aa  46.6  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  22.29 
 
 		 410 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4002  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 765 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 632 aa  46.6  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004463  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.37 
 
 		 784 aa  46.6  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135915  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 946 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 493 aa  46.2  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 675 aa  46.2  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 		 801 aa  46.2  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  25.9 
 
 		 433 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  25.5 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.257658  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4405  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.56 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198423  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1396  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.53 
 
 		 556 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0792453  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.15 
 
 		 1070 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00931  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.37 
 
 		 786 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4342  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.19 
 
 		 779 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 528 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1567  sensory transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 855 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  23.81 
 
 		 257 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4467  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.12 
 
 		 589 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0773722  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4448  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 		 589 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3022  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 1101 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 		 1223 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.39 
 
 		 680 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0218  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 		 855 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.227193  normal  0.9118 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0597  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.25 
 
 		 524 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 407 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2043  histidine kinase  25.93 
 
 		 560 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 722 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  25.79 
 
 		 810 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 		 691 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  26.43 
 
 		 788 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0478  histidine kinase  27.21 
 
 		 560 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  23.61 
 
 		 477 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 668 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 566 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 588 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  22.75 
 
 		 581 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  28.57 
 
 		 645 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 		 557 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.52 
 
 		 1210 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  23.14 
 
 		 630 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02306  hypothetical protein  30.92 
 
 		 576 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 595 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 672 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 		 455 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4382  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.43 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4097  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 766 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 494 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.57 
 
 		 397 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0701  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 540 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0647  CheA signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 		 558 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.188659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  25.52 
 
 		 1211 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 702 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1190  histidine kinase  25 
 
 		 484 aa  43.5  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.496715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 		 1003 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  28.47 
 
 		 412 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 873 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00758089  normal  0.057217 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.95 
 
 		 778 aa  43.5  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  26.23 
 
 		 778 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 557 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03784  sensor histidine kinase  24.31 
 
 		 501 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>