15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46264 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46264  predicted protein  100 
 
 
386 aa  795    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90317  predicted protein  23.18 
 
 
517 aa  84  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50961  predicted protein  26.95 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0280626  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04400  kinase, putative  25.55 
 
 
432 aa  80.1  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06207  pyruvate dehydrogenase kinase (AFU_orthologue; AFUA_2G11900)  24.81 
 
 
405 aa  77  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0955633  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00360  hypothetical protein  25.61 
 
 
462 aa  75.5  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13123  predicted protein  27.85 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46874  predicted protein  28.07 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183113  normal  0.846713 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15081  predicted protein  25.14 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1302  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
871 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465043  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1195  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
870 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98844  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
753 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  27.98 
 
 
779 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 
523 aa  43.1  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 
465 aa  42.7  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>