47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA00360 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA00360  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  955    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04400  kinase, putative  76.97 
 
 		 432 aa  677    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06207  pyruvate dehydrogenase kinase (AFU_orthologue; AFUA_2G11900)  54.98 
 
 		 405 aa  494  9.999999999999999e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0955633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90317  predicted protein  46.45 
 
 		 517 aa  441  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50961  predicted protein  44.33 
 
 		 357 aa  237  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46874  predicted protein  44.37 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183113  normal  0.846713 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13123  predicted protein  36.69 
 
 		 328 aa  196  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15081  predicted protein  37.2 
 
 		 368 aa  153  7e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_09461  pyruvate dehydrogenase kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03240)  27.83 
 
 		 442 aa  129  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10800  mitochondrial pyruvate dehydrogenase kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13600)  29.34 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.403507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29203  probable pyruvate dehydrogenase kinase  20.85 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0107384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46264  predicted protein  25.82 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28836  predicted protein  26.97 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.640365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 612 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1396  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  24.28 
 
 		 556 aa  47  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0792453  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0701  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  23.72 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4375  histidine kinase  31.3 
 
 		 246 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821141  decreased coverage  0.0094806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2950  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 378 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0368  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 		 620 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.49 
 
 		 460 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  26.53 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  26.53 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0794  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00933158  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 581 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 379 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2152  histidine kinase  25.15 
 
 		 342 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.45 
 
 		 680 aa  44.3  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1707  histidine kinase  28.19 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1096  cyclic nucleotide-binding protein  27.88 
 
 		 486 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1190  histidine kinase  28 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.496715  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 1003 aa  44.3  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4097  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 766 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1085  cyclic nucleotide-binding protein  27.88 
 
 		 486 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal  0.0458044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1069  cyclic nucleotide-binding protein  27.88 
 
 		 486 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.998398  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1222  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 686 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583301 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 		 1002 aa  43.5  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  23.72 
 
 		 463 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.53 
 
 		 1001 aa  43.5  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 462 aa  43.5  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2781  histidine kinase  22.41 
 
 		 321 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  28.42 
 
 		 458 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28.24 
 
 		 788 aa  43.1  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3739  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 379 aa  43.1  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 463 aa  43.1  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>