69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_46874 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009364  OSTLU_46874  predicted protein  100 
 
 
396 aa  816    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183113  normal  0.846713 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06207  pyruvate dehydrogenase kinase (AFU_orthologue; AFUA_2G11900)  42.45 
 
 
405 aa  309  5.9999999999999995e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0955633  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50961  predicted protein  45.76 
 
 
357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0280626  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13123  predicted protein  41.09 
 
 
328 aa  252  7e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00360  hypothetical protein  44.37 
 
 
462 aa  242  7e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04400  kinase, putative  45.88 
 
 
432 aa  235  8e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90317  predicted protein  40.62 
 
 
517 aa  225  1e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15081  predicted protein  33.33 
 
 
368 aa  195  9e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10800  mitochondrial pyruvate dehydrogenase kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13600)  29.19 
 
 
483 aa  176  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.403507  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_09461  pyruvate dehydrogenase kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03240)  28.71 
 
 
442 aa  170  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29203  probable pyruvate dehydrogenase kinase  24.16 
 
 
517 aa  130  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0107384  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46264  predicted protein  28.07 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28836  predicted protein  25.27 
 
 
455 aa  77  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.640365  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  27.53 
 
 
448 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.27 
 
 
1795 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 
462 aa  49.7  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25 
 
 
688 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1396  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.76 
 
 
556 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0792453  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0125  Histidine kinase  29.59 
 
 
615 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
450 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2527  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.12 
 
 
1090 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120042  normal  0.0845157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
528 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 
407 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.28 
 
 
487 aa  46.6  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0794  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 
460 aa  46.6  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00933158  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.15 
 
 
1002 aa  46.6  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4122  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 
449 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3608  sensor histidine kinase  31.2 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
470 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
652 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 
439 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4413  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
565 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1445  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
576 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0452635  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
463 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0982  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
377 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  28.7 
 
 
469 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0375  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
494 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
608 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
587 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3513  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
425 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.600596  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  31.67 
 
 
621 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 
468 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
612 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  30.37 
 
 
621 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 
524 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  27.73 
 
 
952 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0336  histidine kinase  28.57 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  29.05 
 
 
445 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
609 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 
1011 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  23.29 
 
 
431 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0478  histidine kinase  28.57 
 
 
560 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676006  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
902 aa  43.9  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0583373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.03 
 
 
1805 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
445 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
379 aa  43.5  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0403  histidine kinase  28.57 
 
 
425 aa  43.9  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335965 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  25.68 
 
 
779 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  25.41 
 
 
686 aa  43.5  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2023  histidine kinase  28.23 
 
 
473 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.618926 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  30 
 
 
458 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3413  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
1093 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.464366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4890  histidine kinase  29.85 
 
 
465 aa  43.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2548  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
861 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 
827 aa  43.1  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0353  hypothetical protein  26 
 
 
471 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4822  histidine kinase  28.46 
 
 
588 aa  43.1  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3380  hypothetical protein  29.84 
 
 
439 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1580  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
478 aa  42.7  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>