26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_90317 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_90317  predicted protein  100 
 
 
517 aa  1075    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00360  hypothetical protein  46.07 
 
 
462 aa  438  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04400  kinase, putative  44.97 
 
 
432 aa  388  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06207  pyruvate dehydrogenase kinase (AFU_orthologue; AFUA_2G11900)  58.33 
 
 
405 aa  375  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0955633  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46874  predicted protein  40.62 
 
 
396 aa  210  4e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183113  normal  0.846713 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50961  predicted protein  37.66 
 
 
357 aa  207  5e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0280626  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13123  predicted protein  37.12 
 
 
328 aa  201  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15081  predicted protein  33.96 
 
 
368 aa  150  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10800  mitochondrial pyruvate dehydrogenase kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13600)  29.88 
 
 
483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.403507  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_09461  pyruvate dehydrogenase kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03240)  26.65 
 
 
442 aa  124  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46264  predicted protein  23.18 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29203  probable pyruvate dehydrogenase kinase  22.44 
 
 
517 aa  72  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0107384  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28836  predicted protein  24.42 
 
 
455 aa  70.1  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.640365  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 
1090 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 
1090 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
612 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 
540 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1575  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 
577 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.09451  normal  0.420465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0345  histidine kinase  30.77 
 
 
861 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.771992 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  30.11 
 
 
469 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 
948 aa  43.9  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46370  putative two-component sensor  35.42 
 
 
540 aa  43.9  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304755  hitchhiker  0.00684988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
641 aa  43.5  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3632  histidine kinase  29.25 
 
 
421 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230628 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3068  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
479 aa  43.5  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000279575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  27.18 
 
 
484 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>