231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47653 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47653  predicted protein  100 
 
 
232 aa  456  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000124104  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47656  hypothetical protein  94.4 
 
 
1166 aa  431  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0223254  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08966  conserved hypothetical protein  37.97 
 
 
675 aa  154  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18410  sodium:neurotransmitter symporter  37.73 
 
 
493 aa  115  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000355087  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1598  sodium-dependent transporter  34.05 
 
 
527 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1300  sodium:neurotransmitter symporter  35.35 
 
 
498 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1026  sodium:neurotransmitter symporter  36.57 
 
 
499 aa  113  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000458175  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02896  hypothetical protein  34.05 
 
 
486 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1714  SNF family sodium-dependent transporter  34.11 
 
 
502 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003007  sodium-dependent transporter  33.19 
 
 
488 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2770  sodium:neurotransmitter symporter  33.94 
 
 
508 aa  109  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000716945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4141  sodium-dependent symporter family protein  33.94 
 
 
508 aa  108  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000962307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3982  sodium-dependent symporter family protein  33.94 
 
 
508 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00011184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3828  sodium-dependent symporter  33.94 
 
 
508 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000226652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4293  sodium-dependent symporter family protein  33.94 
 
 
508 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4204  sodium-dependent symporter family protein  33.94 
 
 
508 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000242154  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3812  sodium-dependent symporter  33.94 
 
 
508 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4093  sodium-dependent symporter family protein  33.94 
 
 
508 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.292750000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0251  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 
524 aa  108  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01290  SNF family Na+-dependent transporter  32.61 
 
 
520 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2254  putative sodium-dependent transporter  33.64 
 
 
488 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2909  sodium:neurotransmitter symporter  31.28 
 
 
506 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.837075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1057  sodium-dependent symporter family protein  33.48 
 
 
508 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0180968  normal  0.0662061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4181  sodium-dependent symporter family protein  33.48 
 
 
508 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000726069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3902  sodium:neurotransmitter symporter  33.03 
 
 
508 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.973236  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3117  sodium:neurotransmitter symporter  32.91 
 
 
499 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1767  sodium:neurotransmitter symporter  30.63 
 
 
492 aa  102  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1119  sodium:neurotransmitter symporter  33.95 
 
 
502 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28780  SNF family Na+-dependent transporter  32.44 
 
 
547 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3446  putative sodium-dependent transporter  35.37 
 
 
495 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0810962  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1761  sodium/proline symporter  41.8 
 
 
498 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0369895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2015  sodium:neurotransmitter symporter  42.62 
 
 
514 aa  99  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14380  SNF family Na+-dependent transporter  40.32 
 
 
505 aa  98.6  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.995834  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3649  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 
498 aa  98.2  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0144867  decreased coverage  0.00339235 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18260  SNF family Na+-dependent transporter  31.98 
 
 
547 aa  98.2  9e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.129568  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0040  sodium:neurotransmitter symporter  35.29 
 
 
510 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2896  sodium:neurotransmitter symporter  31.6 
 
 
503 aa  97.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.634117  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2498  sodium:neurotransmitter symporter  28.05 
 
 
502 aa  95.5  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  39.5 
 
 
466 aa  95.5  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  28.26 
 
 
461 aa  95.1  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07970  SNF family Na+-dependent transporter  33.49 
 
 
553 aa  95.1  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  30.32 
 
 
458 aa  90.9  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  28.83 
 
 
483 aa  90.1  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2162  sodium:neurotransmitter symporter  29.55 
 
 
517 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.227594  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1219  sodium:neurotransmitter symporter  30.09 
 
 
503 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  34.88 
 
 
449 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0491  sodium:neurotransmitter symporter  30.73 
 
 
503 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1202  sodium:neurotransmitter symporter  31.11 
 
 
494 aa  89.7  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0233707  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1417  sodium:neurotransmitter symporter  30.09 
 
 
503 aa  89.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  32.75 
 
 
443 aa  89.7  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1518  sodium:neurotransmitter symporter  42.31 
 
 
497 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  29.41 
 
 
457 aa  87  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  35.29 
 
 
455 aa  86.3  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  28.96 
 
 
454 aa  85.9  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  30.28 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  31.53 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1316  sodium:neurotransmitter symporter  37.29 
 
 
431 aa  84.3  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.745347  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0709  sodium:neurotransmitter symporter  38.46 
 
 
525 aa  83.2  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000643751 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  34.38 
 
 
458 aa  83.2  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  27.75 
 
 
455 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  33.57 
 
 
468 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  29.44 
 
 
447 aa  82.4  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  29.44 
 
 
486 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  29.77 
 
 
447 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  28.9 
 
 
446 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  29.77 
 
 
447 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  29.36 
 
 
446 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  26.87 
 
 
455 aa  82  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  28.9 
 
 
446 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  28.9 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  28.9 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  35.71 
 
 
453 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  30.36 
 
 
454 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  29.36 
 
 
484 aa  80.5  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  28.9 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1621  sodium:neurotransmitter symporter family protein  30.17 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  28.9 
 
 
446 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  28.95 
 
 
454 aa  79.7  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  40.68 
 
 
448 aa  79.7  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  36.6 
 
 
451 aa  79.3  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  29.72 
 
 
470 aa  79.3  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  31.14 
 
 
475 aa  79.3  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  28.44 
 
 
468 aa  79  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  27.98 
 
 
446 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  32.05 
 
 
454 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  32.72 
 
 
488 aa  78.6  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  34.01 
 
 
452 aa  77.8  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  28.44 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  28.44 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  36.52 
 
 
461 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  29.66 
 
 
470 aa  78.2  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  30.04 
 
 
453 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  34.43 
 
 
452 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  36.97 
 
 
451 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  26.34 
 
 
458 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  29.3 
 
 
443 aa  77  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3113  sodium:neurotransmitter symporter  31.16 
 
 
468 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  37.82 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3840  sodium:neurotransmitter symporter  31.16 
 
 
486 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  28.91 
 
 
447 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>