125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_59150 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_59150  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 156 aa  325  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000296817  hitchhiker  0.00187587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4462  single-stranded DNA-binding protein  94.44 
 
 		 162 aa  287  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1522  single-stranded DNA-binding protein  55.97 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0429088 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0991  single-stranded DNA-binding protein  57.5 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187271  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2341  single-stranded DNA-binding protein  57.5 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2820  single-stranded DNA-binding protein  55 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.129154  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0643  single-stranded DNA-binding protein  52.27 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2234  single-stranded DNA-binding protein  55.83 
 
 		 127 aa  140  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3000  single-stranded DNA-binding protein  54.17 
 
 		 146 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0539656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0559  single-stranded DNA-binding protein  54.1 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2920  single-stranded DNA-binding protein  55 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1659  single-stranded DNA-binding protein  51.64 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.403292  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3292  single-stranded DNA-binding protein  55 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2297  single-stranded DNA-binding protein  52.46 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000851295  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3384  single-stranded DNA-binding protein  52.46 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.066334 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1312  single-stranded DNA-binding protein  47.52 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.314977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1446  single-stranded DNA-binding protein  47.52 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00973819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0473  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.223313  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4149  single-stranded DNA-binding protein  45.83 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0290175  hitchhiker  0.00842229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1224  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4427  single-strand DNA-binding protein  34.46 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.36853  normal  0.0713617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  35.14 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  34.23 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  34.23 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  34.23 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  28.36 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  27.78 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  31.3 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  27.63 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  29.36 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  26.75 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  26.75 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  27.27 
 
 		 242 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  25.18 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  28.1 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  26.62 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  27.27 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  28.18 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  30.3 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  27.66 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  28.18 
 
 		 231 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  28.18 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  28.97 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  28.83 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  30 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  29.09 
 
 		 214 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  25.64 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  26.8 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  32.04 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18121  single-stranded DNA-binding protein  28.3 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  hitchhiker  0.00558651  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  28.76 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  28.04 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  25 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  28.37 
 
 		 200 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  27.36 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  28.3 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  29.09 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  25.45 
 
 		 222 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  31.31 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1771  single-strand binding protein  26.42 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0689148  normal  0.0680563 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  27.61 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 301 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  27.36 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  29.91 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  29.06 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  26.42 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  28.95 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2780  single-strand binding protein  26.97 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  26.42 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  26.8 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  27.52 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  26.17 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  26.21 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  27.1 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  26.17 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  28.16 
 
 		 135 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  26.17 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  27.36 
 
 		 133 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  26.36 
 
 		 188 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3832  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 132 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381197  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  27.93 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  30.3 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  27.27 
 
 		 187 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  28.04 
 
 		 181 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18151  single-stranded DNA-binding protein  27.36 
 
 		 124 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  26.17 
 
 		 230 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  27.59 
 
 		 164 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  24.3 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  28.47 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  32.26 
 
 		 234 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  28.95 
 
 		 176 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0296  single-strand binding protein  28.18 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.170779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  27.1 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  25.23 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0774  single-strand binding protein  24.84 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  23.03 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  25.16 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  28.16 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  31.67 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>