53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1522 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1522  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 154 aa  322  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0429088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59150  single-stranded DNA-binding protein  55.97 
 
 		 156 aa  167  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000296817  hitchhiker  0.00187587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4462  single-stranded DNA-binding protein  53.33 
 
 		 162 aa  166  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2820  single-stranded DNA-binding protein  58.65 
 
 		 132 aa  160  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.129154  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0643  single-stranded DNA-binding protein  60.33 
 
 		 149 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0991  single-stranded DNA-binding protein  58.59 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187271  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2341  single-stranded DNA-binding protein  58.59 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2234  single-stranded DNA-binding protein  58.59 
 
 		 127 aa  154  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0559  single-stranded DNA-binding protein  56.8 
 
 		 128 aa  154  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1224  single-stranded DNA-binding protein  52.08 
 
 		 146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1659  single-stranded DNA-binding protein  52.24 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.403292  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0473  single-stranded DNA-binding protein  53.49 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.223313  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2297  single-stranded DNA-binding protein  50.69 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000851295  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3384  single-stranded DNA-binding protein  50.69 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.066334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3000  single-stranded DNA-binding protein  50.7 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0539656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1312  single-stranded DNA-binding protein  48.3 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.314977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1446  single-stranded DNA-binding protein  48.3 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00973819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4149  single-stranded DNA-binding protein  48.98 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0290175  hitchhiker  0.00842229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2920  single-stranded DNA-binding protein  49.25 
 
 		 142 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3292  single-stranded DNA-binding protein  49.25 
 
 		 142 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4427  single-strand DNA-binding protein  33.58 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.36853  normal  0.0713617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2684  single-stranded DNA-binding protein  28.23 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  36.05 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  28.67 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  28.38 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  26.17 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  27.7 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  31.67 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  28.91 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  30.1 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  26.21 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2286  single-strand binding protein  32.5 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2146  single-strand binding protein  32.5 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172996  normal  0.155515 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 161 aa  43.9  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 163 aa  43.9  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  26.35 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  29.6 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  27.1 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  27.03 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  31.76 
 
 		 193 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01895  Single-strand binding protein  26.92 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  27.27 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  26.35 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  28.08 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3832  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 132 aa  41.2  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381197  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  27.62 
 
 		 177 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  27.62 
 
 		 177 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  27.68 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  26.42 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  31.07 
 
 		 301 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>