52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2820 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2820  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 132 aa  273  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.129154  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2341  single-stranded DNA-binding protein  89.34 
 
 		 127 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0991  single-stranded DNA-binding protein  89.34 
 
 		 127 aa  232  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2234  single-stranded DNA-binding protein  89.34 
 
 		 127 aa  231  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0643  single-stranded DNA-binding protein  86.07 
 
 		 149 aa  227  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3000  single-stranded DNA-binding protein  80.67 
 
 		 146 aa  205  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0539656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1224  single-stranded DNA-binding protein  72.44 
 
 		 146 aa  197  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3292  single-stranded DNA-binding protein  71.77 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2920  single-stranded DNA-binding protein  71.77 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1446  single-stranded DNA-binding protein  69.53 
 
 		 150 aa  191  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00973819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1312  single-stranded DNA-binding protein  69.53 
 
 		 150 aa  191  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.314977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4149  single-stranded DNA-binding protein  70.87 
 
 		 146 aa  191  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0290175  hitchhiker  0.00842229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3384  single-stranded DNA-binding protein  69.29 
 
 		 146 aa  188  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.066334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2297  single-stranded DNA-binding protein  69.29 
 
 		 146 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000851295  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0559  single-stranded DNA-binding protein  63.28 
 
 		 128 aa  181  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1659  single-stranded DNA-binding protein  64.57 
 
 		 133 aa  180  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.403292  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0473  single-stranded DNA-binding protein  63.93 
 
 		 133 aa  174  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.223313  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1522  single-stranded DNA-binding protein  58.65 
 
 		 154 aa  160  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0429088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4462  single-stranded DNA-binding protein  52.31 
 
 		 162 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59150  single-stranded DNA-binding protein  55 
 
 		 156 aa  139  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000296817  hitchhiker  0.00187587 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4427  single-strand DNA-binding protein  39.53 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.36853  normal  0.0713617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2684  single-stranded DNA-binding protein  30.23 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  31.63 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  31.2 
 
 		 166 aa  47.4  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 174 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  29.69 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 184 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2286  single-strand binding protein  31.46 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2146  single-strand binding protein  31.46 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172996  normal  0.155515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  32.35 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  29.55 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  29.57 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  30.48 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 161 aa  43.9  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  41.43 
 
 		 301 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  31.13 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  28.43 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 147 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  30 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1357  single-strand binding protein  34.85 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  26.47 
 
 		 230 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  25.89 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  26 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  27.45 
 
 		 186 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>