60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1446 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1446  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 150 aa  310  5.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00973819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1312  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 150 aa  310  5.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.314977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4149  single-stranded DNA-binding protein  91.33 
 
 		 146 aa  278  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0290175  hitchhiker  0.00842229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1224  single-stranded DNA-binding protein  86 
 
 		 146 aa  264  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3384  single-stranded DNA-binding protein  83.33 
 
 		 146 aa  258  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.066334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2297  single-stranded DNA-binding protein  83.33 
 
 		 146 aa  258  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000851295  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0643  single-stranded DNA-binding protein  65.1 
 
 		 149 aa  204  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2341  single-stranded DNA-binding protein  75.41 
 
 		 127 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0991  single-stranded DNA-binding protein  75.41 
 
 		 127 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2234  single-stranded DNA-binding protein  73.77 
 
 		 127 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1659  single-stranded DNA-binding protein  71.31 
 
 		 133 aa  192  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.403292  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2820  single-stranded DNA-binding protein  69.53 
 
 		 132 aa  191  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.129154  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0559  single-stranded DNA-binding protein  69.92 
 
 		 128 aa  190  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3000  single-stranded DNA-binding protein  62.67 
 
 		 146 aa  186  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0539656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0473  single-stranded DNA-binding protein  67.21 
 
 		 133 aa  183  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.223313  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2920  single-stranded DNA-binding protein  63.36 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3292  single-stranded DNA-binding protein  63.36 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1522  single-stranded DNA-binding protein  48.3 
 
 		 154 aa  140  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0429088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59150  single-stranded DNA-binding protein  47.33 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000296817  hitchhiker  0.00187587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4462  single-stranded DNA-binding protein  46.72 
 
 		 162 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4427  single-strand DNA-binding protein  39.57 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.36853  normal  0.0713617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2684  single-stranded DNA-binding protein  32.03 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  28.78 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3832  single-strand binding protein  30.36 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381197  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  28.81 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  27.41 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  25.47 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  25.23 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  25.44 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  27.82 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  25.23 
 
 		 171 aa  43.5  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 126 aa  42.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  26.17 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0123  single-strand binding protein  28.07 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46256  normal  0.222471 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0755  putative single stranded DNA-binding protein  28.04 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  24.81 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  27.45 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  27.18 
 
 		 148 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  26.67 
 
 		 146 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  28.35 
 
 		 188 aa  41.6  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4669  single-strand binding protein  28.44 
 
 		 159 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 301 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  28.72 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  27.82 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  25.23 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  25.23 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  27.45 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3178  single-strand binding protein  30.28 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198152  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  28.43 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  27.82 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  30.59 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  28.57 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3167  single-strand binding protein  28.44 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.860724  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  27.45 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  27.13 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  23.76 
 
 		 167 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 187 aa  40  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>