93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1659 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1659  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 133 aa  274  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.403292  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0473  single-stranded DNA-binding protein  90.23 
 
 		 133 aa  252  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.223313  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1224  single-stranded DNA-binding protein  69.92 
 
 		 146 aa  203  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0559  single-stranded DNA-binding protein  73.23 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2297  single-stranded DNA-binding protein  68.18 
 
 		 146 aa  197  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000851295  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3384  single-stranded DNA-binding protein  68.18 
 
 		 146 aa  197  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.066334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4149  single-stranded DNA-binding protein  68.94 
 
 		 146 aa  194  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0290175  hitchhiker  0.00842229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1312  single-stranded DNA-binding protein  71.31 
 
 		 150 aa  192  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.314977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1446  single-stranded DNA-binding protein  71.31 
 
 		 150 aa  192  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00973819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2341  single-stranded DNA-binding protein  65.87 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0991  single-stranded DNA-binding protein  65.87 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2234  single-stranded DNA-binding protein  65.87 
 
 		 127 aa  185  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0643  single-stranded DNA-binding protein  64.12 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2820  single-stranded DNA-binding protein  64.57 
 
 		 132 aa  180  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.129154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3000  single-stranded DNA-binding protein  59.26 
 
 		 146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0539656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2920  single-stranded DNA-binding protein  53.79 
 
 		 142 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3292  single-stranded DNA-binding protein  55.74 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1522  single-stranded DNA-binding protein  52.24 
 
 		 154 aa  147  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0429088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59150  single-stranded DNA-binding protein  51.64 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000296817  hitchhiker  0.00187587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4462  single-stranded DNA-binding protein  51.64 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4427  single-strand DNA-binding protein  40 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.36853  normal  0.0713617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2684  single-stranded DNA-binding protein  30 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  31.63 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  28.97 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  28.04 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2146  single-strand binding protein  28.07 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172996  normal  0.155515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2286  single-strand binding protein  28.07 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  26.67 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 170 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  32.77 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  29.91 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  29.52 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  26.73 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  42.19 
 
 		 240 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  28.09 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2923  single-strand binding protein  29.17 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  29.66 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  35.38 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  27.1 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  27.45 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  27.45 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  28.97 
 
 		 200 aa  44.3  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  28.57 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  30.23 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  28.71 
 
 		 188 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  27.72 
 
 		 167 aa  42.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  27.45 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  29.25 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  32.08 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  27.72 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  27.36 
 
 		 242 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  24.53 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  28.43 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  26.47 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  27.72 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  25.49 
 
 		 200 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  27.18 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  31.33 
 
 		 126 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  28.3 
 
 		 231 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  28.3 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  27.36 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  25.23 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  25.23 
 
 		 186 aa  40.8  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3832  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381197  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  26.47 
 
 		 230 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  32.08 
 
 		 209 aa  41.2  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  27.45 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 230 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  28.16 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  30.19 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4669  single-strand binding protein  28.83 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  27.18 
 
 		 181 aa  40.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  30.1 
 
 		 159 aa  40.4  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 301 aa  40.8  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  30.1 
 
 		 159 aa  40.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  28.16 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  25.71 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  28.16 
 
 		 183 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  26.47 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  28.16 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  24.76 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  27.62 
 
 		 160 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  28.16 
 
 		 186 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  28.16 
 
 		 182 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>