32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2684 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2684  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 132 aa  262  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1224  single-stranded DNA-binding protein  32.58 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3384  single-stranded DNA-binding protein  31.06 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.066334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2297  single-stranded DNA-binding protein  31.06 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000851295  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0643  single-stranded DNA-binding protein  30.88 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1312  single-stranded DNA-binding protein  32.03 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.314977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1446  single-stranded DNA-binding protein  32.03 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00973819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1659  single-stranded DNA-binding protein  30 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.403292  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0473  single-stranded DNA-binding protein  28.91 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.223313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0991  single-stranded DNA-binding protein  32.26 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187271  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4149  single-stranded DNA-binding protein  32.58 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0290175  hitchhiker  0.00842229 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2341  single-stranded DNA-binding protein  32.26 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2234  single-stranded DNA-binding protein  31.45 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2820  single-stranded DNA-binding protein  30.23 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.129154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1522  single-stranded DNA-binding protein  28.23 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0429088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3000  single-stranded DNA-binding protein  29.32 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0539656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2920  single-stranded DNA-binding protein  28.46 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0559  single-stranded DNA-binding protein  28.35 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3292  single-stranded DNA-binding protein  28.46 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4427  single-strand DNA-binding protein  25.19 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.36853  normal  0.0713617 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4462  single-stranded DNA-binding protein  25.83 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  37.21 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59150  single-stranded DNA-binding protein  25.83 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000296817  hitchhiker  0.00187587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  34.45 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  36.05 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  36.05 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  36.05 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  36.05 
 
 		 170 aa  40  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  30 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  33.9 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>