60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0473 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0473  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 133 aa  275  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.223313  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1659  single-stranded DNA-binding protein  90.23 
 
 		 133 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.403292  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0559  single-stranded DNA-binding protein  71.65 
 
 		 128 aa  197  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1224  single-stranded DNA-binding protein  70.31 
 
 		 146 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2297  single-stranded DNA-binding protein  66.41 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000851295  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3384  single-stranded DNA-binding protein  66.41 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.066334 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1446  single-stranded DNA-binding protein  67.21 
 
 		 150 aa  183  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00973819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1312  single-stranded DNA-binding protein  67.21 
 
 		 150 aa  183  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.314977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4149  single-stranded DNA-binding protein  65.35 
 
 		 146 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0290175  hitchhiker  0.00842229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0991  single-stranded DNA-binding protein  64.29 
 
 		 127 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187271  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2341  single-stranded DNA-binding protein  64.29 
 
 		 127 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2234  single-stranded DNA-binding protein  65.32 
 
 		 127 aa  179  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0643  single-stranded DNA-binding protein  62.3 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2820  single-stranded DNA-binding protein  63.93 
 
 		 132 aa  174  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.129154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3000  single-stranded DNA-binding protein  58.82 
 
 		 146 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0539656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2920  single-stranded DNA-binding protein  54.1 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3292  single-stranded DNA-binding protein  54.1 
 
 		 142 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1522  single-stranded DNA-binding protein  53.49 
 
 		 154 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0429088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59150  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000296817  hitchhiker  0.00187587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4462  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4427  single-strand DNA-binding protein  37.4 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.36853  normal  0.0713617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2684  single-stranded DNA-binding protein  28.91 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  29.59 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2286  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2146  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172996  normal  0.155515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  28.43 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  26.61 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  27.62 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  27.36 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  47.06 
 
 		 240 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  28.04 
 
 		 171 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  27.62 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2923  single-strand binding protein  31.08 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  24.76 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  27.97 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  32.53 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  37.29 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  29.27 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  34.92 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  30.19 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 156 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  29.25 
 
 		 166 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  27.43 
 
 		 200 aa  41.6  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  25.84 
 
 		 164 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  29.41 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  35.29 
 
 		 230 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  23.08 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  25.74 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  30.16 
 
 		 195 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1357  single-strand binding protein  30.86 
 
 		 144 aa  40.8  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  31.15 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3832  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381197  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  30.19 
 
 		 209 aa  40.4  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  28.43 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  27.18 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>