65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0559 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0559  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 128 aa  265  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1659  single-stranded DNA-binding protein  73.23 
 
 		 133 aa  202  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.403292  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0473  single-stranded DNA-binding protein  71.65 
 
 		 133 aa  197  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.223313  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1224  single-stranded DNA-binding protein  70.08 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1446  single-stranded DNA-binding protein  69.92 
 
 		 150 aa  190  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00973819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1312  single-stranded DNA-binding protein  69.92 
 
 		 150 aa  190  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.314977 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2341  single-stranded DNA-binding protein  68.25 
 
 		 127 aa  189  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0991  single-stranded DNA-binding protein  68.25 
 
 		 127 aa  189  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2234  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 		 127 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4149  single-stranded DNA-binding protein  68.85 
 
 		 146 aa  185  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0290175  hitchhiker  0.00842229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3384  single-stranded DNA-binding protein  66.14 
 
 		 146 aa  184  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.066334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2297  single-stranded DNA-binding protein  66.14 
 
 		 146 aa  184  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000851295  hitchhiker  0.000107938 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2820  single-stranded DNA-binding protein  63.28 
 
 		 132 aa  181  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.129154  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0643  single-stranded DNA-binding protein  64.23 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3000  single-stranded DNA-binding protein  62.1 
 
 		 146 aa  174  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0539656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2920  single-stranded DNA-binding protein  59.68 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3292  single-stranded DNA-binding protein  59.68 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1522  single-stranded DNA-binding protein  56.8 
 
 		 154 aa  154  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0429088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4462  single-stranded DNA-binding protein  54.84 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59150  single-stranded DNA-binding protein  54.1 
 
 		 156 aa  135  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000296817  hitchhiker  0.00187587 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4427  single-strand DNA-binding protein  38.52 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.36853  normal  0.0713617 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  29.13 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  28 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  31.19 
 
 		 170 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2684  single-stranded DNA-binding protein  28.35 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  32.14 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  32.04 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  26.67 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  26.67 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  28.3 
 
 		 171 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  30.19 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  27.45 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  25.71 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  27.36 
 
 		 170 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  40.35 
 
 		 161 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2286  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0848  single-strand binding protein family  25.93 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000446358  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2146  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172996  normal  0.155515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 171 aa  42.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  27.97 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  40.35 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  25.25 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  40.35 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  28.57 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  27 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  27.08 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  28.45 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  29.85 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  40.35 
 
 		 156 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  27.36 
 
 		 195 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3832  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  28.43 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  35.94 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0828  single-strand binding protein  28.71 
 
 		 275 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  30.36 
 
 		 172 aa  40.8  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  26.79 
 
 		 183 aa  40.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  27.19 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  25.66 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  28.3 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  28.3 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  28.43 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  28.57 
 
 		 209 aa  40.4  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>