More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_51659 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009370  OSTLU_51659  predicted protein  100 
 
 
338 aa  702    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0346324 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20360  precursor of dehydrogenase pyruvate dehydrogenase E1, alpha and beta subunits  70.68 
 
 
814 aa  471  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387314  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  38.04 
 
 
327 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5078  transketolase, central region  37.73 
 
 
327 aa  222  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1491  transketolase  38.53 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  37.88 
 
 
327 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2883  Transketolase central region  38.18 
 
 
327 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3213  Transketolase central region  38.23 
 
 
327 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0143  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  37.38 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1029  Transketolase central region  37.89 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005679 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07151  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  36.75 
 
 
327 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.132194 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0281  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  36.45 
 
 
329 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.177643  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09511  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  36.56 
 
 
329 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.789221  normal  0.154301 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16211  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  36.97 
 
 
327 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.220601 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10131  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  36.5 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0453962  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1280  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  35.24 
 
 
327 aa  200  3e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09301  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  35.76 
 
 
327 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0869  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  36.06 
 
 
327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09281  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  36.06 
 
 
327 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1190  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  35.24 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407117  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  35.37 
 
 
325 aa  191  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  33.33 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.93 
 
 
467 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  33.75 
 
 
328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  35.24 
 
 
325 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.94 
 
 
469 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  32.43 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.93 
 
 
467 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  34.43 
 
 
327 aa  178  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  34.86 
 
 
327 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  33.23 
 
 
325 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  31.74 
 
 
325 aa  176  6e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2675  Transketolase central region  34.58 
 
 
326 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3069  pyruvate dehydrogenase, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  34.58 
 
 
326 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.829686  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  31.19 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1093  pyruvate dehydrogenase subunit beta  32.74 
 
 
464 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584062  normal  0.0239853 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  31.87 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  31.87 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  31.87 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12625  predicted protein  33.23 
 
 
327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.549131  normal  0.616561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.64 
 
 
465 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  32.04 
 
 
328 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  33.13 
 
 
328 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  34.05 
 
 
480 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.23 
 
 
454 aa  172  9e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  32.43 
 
 
326 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2110  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  33.44 
 
 
326 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.140374  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  32.04 
 
 
326 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  31.1 
 
 
328 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0473  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.43 
 
 
332 aa  171  2e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.867083  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1817  pyruvate dehydrogenase subunit beta  34.08 
 
 
465 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416682  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5897  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.44 
 
 
497 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  31.69 
 
 
337 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0654  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  35.33 
 
 
327 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.13 
 
 
459 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.33 
 
 
482 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  32.52 
 
 
332 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2060  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.33 
 
 
465 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0989  pyruvate dehydrogenase subunit beta  32.92 
 
 
480 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114856  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  34.92 
 
 
468 aa  169  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2787  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.03 
 
 
469 aa  169  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1797  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.03 
 
 
463 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.211938  hitchhiker  0.000618352 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4049  pyruvate dehydrogenase subunit beta  32.14 
 
 
463 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0911544  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1086  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.54 
 
 
448 aa  169  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  32.73 
 
 
483 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1128  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.23 
 
 
461 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997621  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1604  pyruvate dehydrogenase subunit beta  32.93 
 
 
461 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00806914  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  33.77 
 
 
327 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  30.79 
 
 
328 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1148  pyruvate dehydrogenase subunit beta  31.85 
 
 
463 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1077  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.23 
 
 
465 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406758  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3208  pyruvate dehydrogenase subunit beta  34.05 
 
 
469 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.74 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.33 
 
 
456 aa  167  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1225  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.13 
 
 
466 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18840  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  34.04 
 
 
356 aa  166  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3891  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.93 
 
 
456 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0362581  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5153  pyruvate dehydrogenase subunit beta  32.11 
 
 
456 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467221  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1750  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.13 
 
 
474 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0526  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.53 
 
 
466 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0098  pyruvate dehydrogenase subunit beta  30.84 
 
 
332 aa  165  9e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  31.45 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3890  pyruvate dehydrogenase subunit beta  32.42 
 
 
456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440755  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  32.7 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0746  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.53 
 
 
332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.339264  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1506  pyruvate dehydrogenase subunit beta  34.25 
 
 
458 aa  162  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100072  normal  0.335973 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  32.53 
 
 
449 aa  162  9e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  30.25 
 
 
343 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1629  pyruvate dehydrogenase subunit beta  32.7 
 
 
466 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.407235  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1812  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit, putative  31.91 
 
 
330 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0733461  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2159  pyruvate dehydrogenase subunit beta  32.12 
 
 
451 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.881738  normal  0.475194 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1489  Transketolase central region  31.91 
 
 
330 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0929  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  28.7 
 
 
324 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0162  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.43 
 
 
448 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00341074 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  30.95 
 
 
327 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  30.95 
 
 
327 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0517  pyruvate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  31.19 
 
 
328 aa  159  5e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1690  pyruvate dehydrogenase subunit beta  31.83 
 
 
464 aa  159  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1078  pyruvate dehydrogenase subunit beta  32.13 
 
 
458 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00798693  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2114  pyruvate dehydrogenase subunit beta  33.84 
 
 
461 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>