More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1812 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1812  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit, putative  100 
 
 		 330 aa  679    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0733461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1489  Transketolase central region  100 
 
 		 330 aa  679    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2110  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  50.77 
 
 		 326 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.140374  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3069  pyruvate dehydrogenase, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  50.92 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.829686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2675  Transketolase central region  50.92 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  52.62 
 
 		 328 aa  331  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  50.15 
 
 		 328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  49.38 
 
 		 327 aa  323  4e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  48.17 
 
 		 328 aa  318  9e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  47.87 
 
 		 328 aa  315  9e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  50.31 
 
 		 332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  49.54 
 
 		 328 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1491  transketolase  47.53 
 
 		 327 aa  311  7.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2883  Transketolase central region  48.15 
 
 		 327 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3213  Transketolase central region  48.15 
 
 		 327 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0654  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  48.16 
 
 		 327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18840  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  51.69 
 
 		 356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4805  Transketolase central region  47.75 
 
 		 337 aa  309  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5078  transketolase, central region  47.53 
 
 		 327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  47.55 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  47.68 
 
 		 324 aa  305  7e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1029  Transketolase central region  46.91 
 
 		 324 aa  302  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005679 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2324  transketolase, central region  47.65 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0143  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dehydrogenase (E1) component  47.06 
 
 		 326 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  50.48 
 
 		 331 aa  294  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  45.57 
 
 		 328 aa  293  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1280  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  45.85 
 
 		 327 aa  293  4e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16211  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  45.54 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.220601 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  43.38 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  45.82 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0589  transketolase, central region  47.53 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154165  normal  0.609901 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0281  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  44.65 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.177643  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09511  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  44.65 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.789221  normal  0.154301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2176  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta2 component  43.75 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.70271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3707  Transketolase central region  46.6 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  44.34 
 
 		 327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.42 
 
 		 459 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3038  transketolase central region  45.99 
 
 		 325 aa  285  5.999999999999999e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09301  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  44.75 
 
 		 327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0869  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  44.75 
 
 		 327 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5165  Transketolase central region  44 
 
 		 326 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  48.1 
 
 		 456 aa  283  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  42.77 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07151  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  44 
 
 		 327 aa  281  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.132194 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09281  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  44.44 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12625  predicted protein  45.82 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.549131  normal  0.616561 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13273  dihydrolipoamide acetyltransferase  42.77 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.11 
 
 		 465 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  44.79 
 
 		 325 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.17 
 
 		 469 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  44.79 
 
 		 325 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  44.79 
 
 		 325 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10131  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  43.6 
 
 		 327 aa  279  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0453962  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.86 
 
 		 467 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3890  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.48 
 
 		 456 aa  277  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440755  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1190  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  43.38 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0929  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  44.86 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.65 
 
 		 482 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44 
 
 		 483 aa  276  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  42.46 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0520  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.25 
 
 		 460 aa  275  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2787  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.34 
 
 		 469 aa  275  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  46.42 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  44.2 
 
 		 320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.75 
 
 		 449 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.03 
 
 		 332 aa  272  5.000000000000001e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  42.59 
 
 		 332 aa  272  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0098  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.64 
 
 		 332 aa  272  7e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.51 
 
 		 467 aa  272  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  44.34 
 
 		 325 aa  272  7e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1093  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.94 
 
 		 464 aa  272  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584062  normal  0.0239853 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  44.16 
 
 		 322 aa  272  7e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6516  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.6 
 
 		 480 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  43.53 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3509  Transketolase central region  41.1 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6441  Transketolase central region  42.11 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.818323 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  42.51 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.39 
 
 		 468 aa  269  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  42.51 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  48.44 
 
 		 335 aa  269  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0162  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.9 
 
 		 448 aa  269  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00341074 
 
 
-
 
NC_002978  WD0473  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.9 
 
 		 332 aa  268  7e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.867083  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1690  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.26 
 
 		 464 aa  268  7e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.872037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5897  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.93 
 
 		 497 aa  268  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1148  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.25 
 
 		 463 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0989  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.4 
 
 		 480 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114856  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5153  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.55 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  45.62 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4049  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.25 
 
 		 463 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0911544  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1750  pyruvate dehydrogenase subunit beta  43.6 
 
 		 474 aa  267  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0535  pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta  46.25 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1817  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.73 
 
 		 465 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.416682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5215  Transketolase central region  44.04 
 
 		 343 aa  264  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1409  transketolase, central region  45.28 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831703 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  42.9 
 
 		 324 aa  263  4e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1610  transketolase, central region  44.38 
 
 		 333 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3570  Transketolase central region  46.48 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0714201 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4646  Transketolase central region  46.48 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0509  transketolase, central region  44.1 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  45.2 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>