More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_40894 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_40894  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  100 
 
 
304 aa  622  1e-177  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0362911  normal  0.846713 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  35.21 
 
 
278 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9161  predicted protein  33.64 
 
 
229 aa  128  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0499099  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  32.99 
 
 
246 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  31.1 
 
 
256 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.41 
 
 
249 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02790  conserved hypothetical protein  28.14 
 
 
462 aa  98.2  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  31.16 
 
 
252 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  32.26 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  30.94 
 
 
365 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  31.86 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  31.86 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  31.86 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  29.72 
 
 
255 aa  89.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  27.83 
 
 
255 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  27.96 
 
 
255 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  27.96 
 
 
255 aa  89.7  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  27.96 
 
 
255 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  27.96 
 
 
255 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  27.96 
 
 
255 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  31.37 
 
 
260 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  31.37 
 
 
260 aa  89.4  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  31.37 
 
 
260 aa  89  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  34.38 
 
 
271 aa  89  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  29.86 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1537  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.84 
 
 
454 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000836687  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  31.37 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  29.84 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  31.37 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  28.57 
 
 
255 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  28.38 
 
 
258 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  31.71 
 
 
213 aa  87  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  29.61 
 
 
314 aa  86.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  31.4 
 
 
254 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  28.16 
 
 
255 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  26.99 
 
 
384 aa  85.9  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  29.17 
 
 
269 aa  85.5  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  30.88 
 
 
260 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57776  predicted protein  25.49 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257142  normal  0.0748779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.24 
 
 
554 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  29.02 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.24 
 
 
554 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  27.78 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  27.31 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5012  60 kDa inner membrane insertion protein  27.34 
 
 
567 aa  82.4  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  25.82 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.4 
 
 
544 aa  81.6  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.02 
 
 
553 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4242  60 kDa inner membrane insertion protein  28.69 
 
 
571 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00149519  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0131  60 kDa inner membrane insertion protein  28.72 
 
 
459 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  25.6 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  26.42 
 
 
543 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.03 
 
 
531 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.88 
 
 
581 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  25.88 
 
 
547 aa  79.3  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42866  predicted protein  23.38 
 
 
664 aa  79  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  29.13 
 
 
548 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6056  60 kDa inner membrane insertion protein  27.87 
 
 
570 aa  79  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  27.34 
 
 
569 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4793  protein translocase subunit yidC  26.59 
 
 
565 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.98 
 
 
555 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  26.94 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  24.8 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  25.69 
 
 
514 aa  77.8  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.26 
 
 
518 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3542  YidC translocase/secretase  26.69 
 
 
569 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43657  predicted protein  27.61 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.67 
 
 
552 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.67 
 
 
552 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.67 
 
 
553 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.67 
 
 
554 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.09 
 
 
558 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.09 
 
 
558 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.09 
 
 
558 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4905  protein translocase subunit yidC  26.97 
 
 
580 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  29.5 
 
 
531 aa  77  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  28.57 
 
 
541 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.09 
 
 
558 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  28.57 
 
 
541 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.09 
 
 
558 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.09 
 
 
557 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.09 
 
 
558 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.09 
 
 
558 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.38 
 
 
517 aa  76.3  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.22 
 
 
554 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.88 
 
 
536 aa  75.9  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  28.25 
 
 
553 aa  76.3  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.9 
 
 
544 aa  75.9  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.08 
 
 
541 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.44 
 
 
533 aa  75.9  0.0000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  28.57 
 
 
541 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  29.19 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  28.14 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.78 
 
 
553 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4140  protein translocase subunit yidC  26.29 
 
 
570 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.555817 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.99 
 
 
567 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  25.47 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.78 
 
 
550 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  28.57 
 
 
541 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  28.18 
 
 
557 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>