More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_3450 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009361  OSTLU_3450  predicted protein  100 
 
 		 427 aa  881    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.688241 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03373  DNA-directed polymerase kappa, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01270)  35.17 
 
 		 612 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04490  conserved hypothetical protein  37.2 
 
 		 658 aa  229  7e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25495  predicted protein  32.82 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.903436  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  37.54 
 
 		 385 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  32.85 
 
 		 360 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 481 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  35.42 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  35.1 
 
 		 386 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  34.77 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  34.11 
 
 		 368 aa  175  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  35.76 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  36.25 
 
 		 363 aa  170  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  35.36 
 
 		 356 aa  169  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  35.13 
 
 		 369 aa  169  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  35.57 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  34.29 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  36.3 
 
 		 353 aa  167  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  34.35 
 
 		 363 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  32.9 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  34.02 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  34.02 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  33.81 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  33.04 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  34.3 
 
 		 354 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  32.86 
 
 		 375 aa  163  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  35.28 
 
 		 410 aa  162  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  34.72 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  31.61 
 
 		 356 aa  162  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  34.62 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  34.6 
 
 		 359 aa  160  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  35.06 
 
 		 381 aa  159  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  34.02 
 
 		 417 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  35.36 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  31.53 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  33.92 
 
 		 345 aa  158  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  33.82 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  35.78 
 
 		 396 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  32.86 
 
 		 430 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  32.94 
 
 		 423 aa  156  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  32.55 
 
 		 393 aa  156  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  32.02 
 
 		 408 aa  156  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  34.16 
 
 		 378 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3809  DNA-directed DNA polymerase  43.27 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  33.33 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  33.64 
 
 		 359 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  33.14 
 
 		 466 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  32.95 
 
 		 360 aa  153  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0383  ImpB/MucB/SamB family protein  37.23 
 
 		 357 aa  153  7e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00108419  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  30.7 
 
 		 426 aa  152  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  32.01 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0762  DNA polymerase IV  40.74 
 
 		 352 aa  152  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  35.81 
 
 		 373 aa  152  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  41.15 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  30.1 
 
 		 425 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  32.76 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  32.81 
 
 		 419 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00226  DNA polymerase IV  40.65 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3376  DNA-directed DNA polymerase  40.65 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3349  DNA polymerase IV  40.65 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13630  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  35.01 
 
 		 458 aa  150  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00229  hypothetical protein  40.65 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0276  DNA polymerase IV  41.26 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0265  DNA polymerase IV  40.65 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0260  DNA polymerase IV  41.26 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1586  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  32.76 
 
 		 361 aa  150  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0285  DNA polymerase IV  41.26 
 
 		 351 aa  149  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  33.82 
 
 		 410 aa  149  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 399 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  30.35 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0385  DNA polymerase IV  32.54 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.434794  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3308  DNA polymerase IV  41.35 
 
 		 352 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00714145  hitchhiker  0.00000429031 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  32.07 
 
 		 354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  33.05 
 
 		 359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  31.36 
 
 		 834 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0228  DNA polymerase IV  40.38 
 
 		 354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.190428  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  33.43 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0962  DNA polymerase IV  41.26 
 
 		 353 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  31.05 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3157  DNA polymerase IV  40.87 
 
 		 352 aa  147  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  30.49 
 
 		 390 aa  147  5e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3296  DNA polymerase IV  40.87 
 
 		 352 aa  147  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  32.81 
 
 		 357 aa  146  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  33.54 
 
 		 413 aa  146  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  31.16 
 
 		 432 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  30.43 
 
 		 395 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  34.18 
 
 		 360 aa  145  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  41.83 
 
 		 364 aa  145  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  32.55 
 
 		 412 aa  145  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0362  DNA polymerase IV  40.28 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0343  DNA polymerase IV  40.28 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.663031 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  32.81 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  40.28 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.990512 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  31.52 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0354  DNA polymerase IV  40.28 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360383 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0347  DNA polymerase IV  40.28 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  28.08 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0597  DNA polymerase IV  34.38 
 
 		 355 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  35.22 
 
 		 360 aa  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>