More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_26048 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009364  OSTLU_26048  MFS family transporter: multidrug efflux  100 
 
 
374 aa  743    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00479795  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45584  predicted protein  34.64 
 
 
544 aa  163  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  24.8 
 
 
685 aa  91.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  26.15 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.02 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.87 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  25.64 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.77 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.71 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.45 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.99 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
406 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.71 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.71 
 
 
405 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.43 
 
 
405 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.81 
 
 
430 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.2 
 
 
409 aa  63.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  23.94 
 
 
444 aa  63.5  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 
415 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 
496 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.01 
 
 
444 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0451  putative MFS transporter  29.17 
 
 
353 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.892159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.71 
 
 
434 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  30 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  30 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.05 
 
 
483 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.34 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 
489 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  30 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 
405 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.21 
 
 
411 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.39 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.21 
 
 
411 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0616341 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1458  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.5 
 
 
399 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00531988  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.08 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  32.89 
 
 
403 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.78 
 
 
429 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.03 
 
 
409 aa  60.1  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
435 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  28.85 
 
 
401 aa  60.1  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  24.38 
 
 
411 aa  60.1  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  26.44 
 
 
461 aa  59.7  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  32.85 
 
 
399 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  33.33 
 
 
406 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  28.28 
 
 
426 aa  59.3  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  33.33 
 
 
406 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 
405 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 
409 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  24.41 
 
 
417 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.99 
 
 
505 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  24.15 
 
 
486 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 
458 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  25.29 
 
 
412 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 
405 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  28.67 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.09 
 
 
458 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.4 
 
 
474 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 
496 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.07 
 
 
411 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  25.1 
 
 
411 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06034  hypothetical protein  26.52 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3480  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 
530 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_003296  RS01786  transport transmembrane protein  35.43 
 
 
537 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  26.84 
 
 
424 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  23.35 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0371  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
425 aa  57.4  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4552  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 
530 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.830403  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  28.67 
 
 
462 aa  57.4  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  30.22 
 
 
419 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
411 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  23.42 
 
 
444 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 
396 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  28.67 
 
 
404 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  27.59 
 
 
405 aa  57  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.21 
 
 
530 aa  57.4  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4034  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.94 
 
 
428 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0057  major facilitator transporter  23.59 
 
 
478 aa  57  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  30.84 
 
 
466 aa  57  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
424 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  30.22 
 
 
405 aa  57  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  22.71 
 
 
411 aa  56.6  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
408 aa  56.6  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  26.67 
 
 
453 aa  56.2  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  33.04 
 
 
539 aa  56.2  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
497 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
455 aa  56.2  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  32.41 
 
 
465 aa  56.2  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.54 
 
 
504 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  29.41 
 
 
411 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.41 
 
 
400 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.41 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.41 
 
 
400 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0422  hypothetical protein  29.58 
 
 
455 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  28 
 
 
454 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  28 
 
 
454 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.41 
 
 
400 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  31.21 
 
 
406 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  22.82 
 
 
500 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>