More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1296 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1296  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
344 aa  709    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.181598  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1319  branched-chain amino acid aminotransferase  74.19 
 
 
347 aa  507  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.724112  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0635  branched-chain amino acid aminotransferase  60.71 
 
 
340 aa  428  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000185267  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1152  branched-chain amino acid aminotransferase  61.45 
 
 
340 aa  424  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000440296  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1148  branched-chain amino acid aminotransferase  56.25 
 
 
339 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1332  branched-chain amino acid aminotransferase  55.65 
 
 
339 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2743  branched-chain amino acid aminotransferase  55.49 
 
 
339 aa  399  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646855  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1772  branched-chain amino acid aminotransferase  57.4 
 
 
341 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0397129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1501  branched-chain amino acid aminotransferase  57.4 
 
 
341 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.211929  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0494  branched-chain amino acid aminotransferase  57.74 
 
 
339 aa  400  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0962388  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1409  branched-chain amino acid aminotransferase  56.21 
 
 
340 aa  389  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3467  branched-chain amino acid aminotransferase  53.57 
 
 
339 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3511  branched-chain amino acid aminotransferase  54.46 
 
 
339 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137347  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2410  branched-chain amino acid aminotransferase  54.17 
 
 
339 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428116  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2264  branched-chain amino acid aminotransferase  54.17 
 
 
339 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2417  branched-chain amino acid aminotransferase  54.17 
 
 
339 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204279  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12950  branched-chain amino acid aminotransferase  51.59 
 
 
345 aa  345  8.999999999999999e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.765699  normal  0.148306 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08670  branched-chain amino acid aminotransferase  50.72 
 
 
345 aa  340  2e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00341409  normal  0.322346 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1071  branched-chain amino acid aminotransferase  49.71 
 
 
348 aa  336  2.9999999999999997e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1290  branched-chain amino acid aminotransferase  48.8 
 
 
339 aa  318  1e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50793  predicted protein  44.97 
 
 
409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.141082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2144  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 
358 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0195  branched-chain amino acid aminotransferase  42.57 
 
 
358 aa  246  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0591  branched-chain amino acid aminotransferase  42.94 
 
 
358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0577  branched-chain amino acid aminotransferase  42.94 
 
 
358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1524  branched-chain amino acid aminotransferase  40.41 
 
 
367 aa  244  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2671  branched-chain amino acid aminotransferase  40.29 
 
 
367 aa  242  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4107  branched-chain amino acid aminotransferase  42.68 
 
 
366 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.456695 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  42.68 
 
 
366 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  39.83 
 
 
357 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000422235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2588  branched-chain amino acid aminotransferase  40.8 
 
 
354 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000807633  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31397  predicted protein  40.48 
 
 
336 aa  239  6.999999999999999e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.635842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0572  branched-chain amino acid aminotransferase  40.76 
 
 
356 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000149445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0585  branched-chain amino acid aminotransferase  40.48 
 
 
356 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1388  branched-chain amino acid aminotransferase  39.88 
 
 
370 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632887  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0537  branched-chain amino acid aminotransferase  39.02 
 
 
356 aa  235  7e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3886  branched-chain amino acid aminotransferase  41.59 
 
 
370 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184711  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0726  branched-chain amino acid aminotransferase  39.64 
 
 
364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.275399 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2520  branched-chain amino acid aminotransferase  39.53 
 
 
370 aa  233  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.11259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  40.13 
 
 
367 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3069  branched-chain amino acid aminotransferase  38.64 
 
 
371 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.702338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5588  branched-chain amino acid aminotransferase  40.9 
 
 
362 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0289083  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12238  branched-chain amino acid aminotransferase  39.7 
 
 
368 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127743  normal  0.533205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3139  branched-chain amino acid aminotransferase  43.23 
 
 
370 aa  232  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0708  branched-chain amino acid aminotransferase  38.26 
 
 
364 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.315028 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  40.83 
 
 
356 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.335464  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4175  branched-chain amino acid aminotransferase  41.27 
 
 
371 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121006  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3573  branched-chain amino acid aminotransferase  39.05 
 
 
367 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0805126  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0327  branched-chain amino acid aminotransferase  38.32 
 
 
363 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04566  branched-chain amino acid aminotransferase  38.76 
 
 
359 aa  229  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4282  branched-chain amino acid aminotransferase  40.13 
 
 
364 aa  229  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342544  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4854  branched-chain amino acid aminotransferase  41.35 
 
 
370 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1739  branched-chain amino acid aminotransferase  42.24 
 
 
359 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829629  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2940  branched-chain amino acid aminotransferase  37.83 
 
 
367 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0406  branched-chain amino acid aminotransferase  37.46 
 
 
362 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0656  branched-chain amino acid aminotransferase  38.66 
 
 
357 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622258  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09890  branched chain amino acid aminotransferase  38.64 
 
 
373 aa  226  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.03528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2853  branched-chain amino acid aminotransferase  38.19 
 
 
357 aa  226  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000542483  hitchhiker  0.0000000111677 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2663  branched-chain amino acid aminotransferase  38.55 
 
 
353 aa  225  7e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1327  branched-chain amino acid aminotransferase  38.81 
 
 
354 aa  225  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1358  branched-chain amino acid aminotransferase  38.81 
 
 
354 aa  225  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1393  Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase protein  40.71 
 
 
367 aa  225  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2529  branched chain amino acid aminotransferase  36.98 
 
 
370 aa  225  8e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3725  branched-chain amino acid aminotransferase  40.94 
 
 
365 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4643  branched-chain amino acid aminotransferase  40.94 
 
 
365 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  39.13 
 
 
357 aa  225  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.467391  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4288  branched-chain amino acid aminotransferase  38.48 
 
 
365 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5661  branched-chain amino acid aminotransferase  40.64 
 
 
365 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0278  branched-chain amino acid aminotransferase  36.36 
 
 
363 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0047  branched-chain amino acid aminotransferase  39.64 
 
 
361 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0858  branched-chain-amino-acid transaminase  38.15 
 
 
389 aa  224  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1240  branched-chain amino acid aminotransferase  38.02 
 
 
365 aa  222  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0857  branched-chain amino acid aminotransferase  38.62 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0975  branched-chain amino acid aminotransferase  38.62 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.568362  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2267  branched-chain amino acid aminotransferase  36.69 
 
 
370 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4176  branched-chain amino acid aminotransferase  37.03 
 
 
363 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.575055 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0856  branched chain amino acid aminotransferase  38.89 
 
 
356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3098  branched-chain amino acid aminotransferase  37.58 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2596  branched-chain amino acid aminotransferase  38.14 
 
 
362 aa  220  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2638  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 
359 aa  219  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000340961  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0778  branched-chain amino acid aminotransferase  38.32 
 
 
359 aa  219  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3370  branched-chain amino acid aminotransferase  38.71 
 
 
368 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.142913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3319  branched-chain amino acid aminotransferase  38.71 
 
 
368 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3308  branched-chain amino acid aminotransferase  38.71 
 
 
368 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3303  branched-chain amino acid aminotransferase  37.28 
 
 
355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0289  branched-chain amino acid aminotransferase  36.28 
 
 
363 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.351269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3634  branched-chain amino acid aminotransferase  36.53 
 
 
363 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0310  branched-chain amino acid aminotransferase  36.53 
 
 
363 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3830  branched-chain amino acid aminotransferase  36.53 
 
 
363 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0176  branched-chain amino acid aminotransferase  37.76 
 
 
371 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3299  branched-chain amino acid aminotransferase  36.04 
 
 
361 aa  215  9e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0340  branched-chain amino acid aminotransferase  36.23 
 
 
363 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3649  branched-chain amino acid aminotransferase  36.53 
 
 
363 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0586  branched-chain amino acid aminotransferase  38.15 
 
 
375 aa  214  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  34.87 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1703  branched-chain amino acid aminotransferase  39.37 
 
 
375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0434544 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3425  branched-chain amino acid aminotransferase  38.17 
 
 
365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3367  branched chain amino acid aminotransferase  35.59 
 
 
357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215737  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2382  branched-chain amino acid aminotransferase  36.83 
 
 
377 aa  212  9e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4084  branched-chain amino acid aminotransferase  40.19 
 
 
359 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>