More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0278 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0406  branched-chain amino acid aminotransferase  88.92 
 
 		 362 aa  687    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0340  branched-chain amino acid aminotransferase  82.92 
 
 		 363 aa  649    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0327  branched-chain amino acid aminotransferase  86.15 
 
 		 363 aa  668    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0278  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 363 aa  758    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4176  branched-chain amino acid aminotransferase  87.05 
 
 		 363 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.575055 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3649  branched-chain amino acid aminotransferase  82.09 
 
 		 363 aa  645    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3634  branched-chain amino acid aminotransferase  83.2 
 
 		 363 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0310  branched-chain amino acid aminotransferase  83.2 
 
 		 363 aa  652    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3830  branched-chain amino acid aminotransferase  83.2 
 
 		 363 aa  652    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0289  branched-chain amino acid aminotransferase  80.94 
 
 		 363 aa  632  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.351269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0414  branched-chain amino acid aminotransferase  80.44 
 
 		 363 aa  632  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.718054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4027  branched-chain amino acid aminotransferase  81.77 
 
 		 363 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4146  branched-chain amino acid aminotransferase  81.49 
 
 		 363 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  81.49 
 
 		 363 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4053  branched-chain amino acid aminotransferase  81.49 
 
 		 363 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3299  branched-chain amino acid aminotransferase  78.61 
 
 		 361 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  43.27 
 
 		 357 aa  300  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000422235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0856  branched chain amino acid aminotransferase  43.79 
 
 		 356 aa  298  9e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2638  branched-chain amino acid aminotransferase  43.77 
 
 		 359 aa  295  7e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000340961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0537  branched-chain amino acid aminotransferase  44.78 
 
 		 356 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0572  branched-chain amino acid aminotransferase  42.78 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000149445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0591  branched-chain amino acid aminotransferase  45.8 
 
 		 358 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0577  branched-chain amino acid aminotransferase  45.8 
 
 		 358 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0656  branched-chain amino acid aminotransferase  43.33 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2853  branched-chain amino acid aminotransferase  42.82 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000542483  hitchhiker  0.0000000111677 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0195  branched-chain amino acid aminotransferase  43.75 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0585  branched-chain amino acid aminotransferase  42.49 
 
 		 356 aa  286  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3098  branched-chain amino acid aminotransferase  41.6 
 
 		 357 aa  284  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  41.01 
 
 		 356 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.335464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2588  branched-chain amino acid aminotransferase  42.54 
 
 		 354 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000807633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  42 
 
 		 357 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.467391  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2663  branched-chain amino acid aminotransferase  41.14 
 
 		 353 aa  276  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2671  branched-chain amino acid aminotransferase  41.39 
 
 		 367 aa  273  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2144  branched-chain amino acid aminotransferase  42.12 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0047  branched-chain amino acid aminotransferase  42.39 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4107  branched-chain amino acid aminotransferase  40.56 
 
 		 366 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456695 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  40.56 
 
 		 366 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2529  branched chain amino acid aminotransferase  41.69 
 
 		 370 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2267  branched-chain amino acid aminotransferase  39.45 
 
 		 370 aa  266  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097897 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1393  Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase protein  40 
 
 		 367 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09890  branched chain amino acid aminotransferase  40.33 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.03528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4288  branched-chain amino acid aminotransferase  40.28 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3543  branched-chain amino acid aminotransferase  40.38 
 
 		 367 aa  263  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417874  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1524  branched-chain amino acid aminotransferase  42.11 
 
 		 367 aa  262  4.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0778  branched-chain amino acid aminotransferase  43.2 
 
 		 359 aa  262  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0726  branched-chain amino acid aminotransferase  41.6 
 
 		 364 aa  262  6e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.275399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7786  branched-chain amino acid aminotransferase  39.89 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3573  branched-chain amino acid aminotransferase  39.78 
 
 		 367 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0805126  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1418  branched-chain amino acid aminotransferase  39.83 
 
 		 377 aa  256  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0616  branched-chain amino acid aminotransferase  39.34 
 
 		 373 aa  255  6e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  42.48 
 
 		 363 aa  256  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229178  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  39.84 
 
 		 367 aa  255  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12238  branched-chain amino acid aminotransferase  39.66 
 
 		 368 aa  255  7e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127743  normal  0.533205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3957  branched-chain amino acid aminotransferase  39.89 
 
 		 379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5588  branched-chain amino acid aminotransferase  39.35 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8041  branched-chain amino acid aminotransferase  39.06 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2596  branched-chain amino acid aminotransferase  40.35 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2919  branched chain amino acid aminotransferase  40.64 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742816  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1703  branched-chain amino acid aminotransferase  40.91 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0434544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2940  branched-chain amino acid aminotransferase  40.94 
 
 		 367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08600  branched chain amino acid aminotransferase  41.34 
 
 		 363 aa  253  5.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.367777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3425  branched-chain amino acid aminotransferase  40.62 
 
 		 365 aa  252  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3303  branched-chain amino acid aminotransferase  37.33 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2382  branched-chain amino acid aminotransferase  39.88 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0586  branched-chain amino acid aminotransferase  39.78 
 
 		 375 aa  250  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4282  branched-chain amino acid aminotransferase  40.3 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342544  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6535  branched-chain amino acid aminotransferase  40.47 
 
 		 372 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1353  branched-chain amino acid aminotransferase  40.74 
 
 		 374 aa  249  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.393805  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3367  branched chain amino acid aminotransferase  41.3 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215737  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3069  branched-chain amino acid aminotransferase  39.01 
 
 		 371 aa  249  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.702338  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5661  branched-chain amino acid aminotransferase  41.18 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1240  branched-chain amino acid aminotransferase  40.53 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2520  branched-chain amino acid aminotransferase  39.61 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.11259 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3725  branched-chain amino acid aminotransferase  40.9 
 
 		 365 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4643  branched-chain amino acid aminotransferase  40.9 
 
 		 365 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3509  branched-chain amino acid aminotransferase  40.62 
 
 		 353 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0259  branched-chain amino acid aminotransferase  39.47 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3308  branched-chain amino acid aminotransferase  39.5 
 
 		 368 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3319  branched-chain amino acid aminotransferase  39.5 
 
 		 368 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3370  branched-chain amino acid aminotransferase  39.5 
 
 		 368 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.142913 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2811  branched-chain amino acid aminotransferase  39.34 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6410  branched-chain amino acid aminotransferase  38.84 
 
 		 374 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.545027 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0711  branched chain amino acid aminotransferase  37.33 
 
 		 361 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0708  branched-chain amino acid aminotransferase  39.44 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315028 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2487  branched-chain amino acid aminotransferase  42.86 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04566  branched-chain amino acid aminotransferase  40.24 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3139  branched-chain amino acid aminotransferase  38.67 
 
 		 370 aa  243  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3577  branched-chain amino acid aminotransferase  40.06 
 
 		 353 aa  242  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1388  branched-chain amino acid aminotransferase  38.67 
 
 		 370 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632887  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6122  branched-chain amino acid aminotransferase  40.23 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0176  branched-chain amino acid aminotransferase  37.47 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2742  branched-chain amino acid aminotransferase  42.56 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10790  branched chain amino acid aminotransferase  40.62 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3428  branched-chain amino acid aminotransferase  40.06 
 
 		 353 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0858  branched-chain-amino-acid transaminase  38.1 
 
 		 389 aa  240  4e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1098  branched-chain amino acid aminotransferase  36.26 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0823676  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0747  branched-chain amino acid aminotransferase  35.51 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.031248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4175  branched-chain amino acid aminotransferase  38.06 
 
 		 371 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3886  branched-chain amino acid aminotransferase  38.06 
 
 		 370 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0889  branched chain amino acid aminotransferase  36.53 
 
 		 355 aa  236  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>