More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2520 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2520  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 370 aa  756    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.11259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1388  branched-chain amino acid aminotransferase  83.74 
 
 		 370 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632887  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3886  branched-chain amino acid aminotransferase  84.82 
 
 		 370 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3139  branched-chain amino acid aminotransferase  89.19 
 
 		 370 aa  684    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4175  branched-chain amino acid aminotransferase  82.16 
 
 		 371 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4854  branched-chain amino acid aminotransferase  82.97 
 
 		 370 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1739  branched-chain amino acid aminotransferase  83.47 
 
 		 359 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829629  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0726  branched-chain amino acid aminotransferase  65.48 
 
 		 364 aa  485  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.275399 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0778  branched-chain amino acid aminotransferase  66.2 
 
 		 359 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1240  branched-chain amino acid aminotransferase  63.01 
 
 		 365 aa  482  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  64.89 
 
 		 366 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4107  branched-chain amino acid aminotransferase  64.89 
 
 		 366 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3425  branched-chain amino acid aminotransferase  66.3 
 
 		 365 aa  474  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5588  branched-chain amino acid aminotransferase  64.62 
 
 		 362 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1393  Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase protein  61.69 
 
 		 367 aa  464  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4084  branched-chain amino acid aminotransferase  65.92 
 
 		 359 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0047  branched-chain amino acid aminotransferase  63.92 
 
 		 361 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1130  branched-chain amino acid aminotransferase  61.92 
 
 		 365 aa  450  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5661  branched-chain amino acid aminotransferase  63.43 
 
 		 365 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3725  branched-chain amino acid aminotransferase  63.43 
 
 		 365 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4643  branched-chain amino acid aminotransferase  63.43 
 
 		 365 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4282  branched-chain amino acid aminotransferase  60.17 
 
 		 364 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342544  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4288  branched-chain amino acid aminotransferase  57.3 
 
 		 365 aa  442  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1327  branched-chain amino acid aminotransferase  60.78 
 
 		 354 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1358  branched-chain amino acid aminotransferase  60.78 
 
 		 354 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2671  branched-chain amino acid aminotransferase  61.17 
 
 		 367 aa  437  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2487  branched-chain amino acid aminotransferase  60.81 
 
 		 366 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2742  branched-chain amino acid aminotransferase  61 
 
 		 366 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0711  branched chain amino acid aminotransferase  57.1 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0616  branched-chain amino acid aminotransferase  56.51 
 
 		 373 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1353  branched-chain amino acid aminotransferase  59.05 
 
 		 374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.393805  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3957  branched-chain amino acid aminotransferase  57.31 
 
 		 379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0176  branched-chain amino acid aminotransferase  55.68 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  53.87 
 
 		 367 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2811  branched-chain amino acid aminotransferase  57.38 
 
 		 363 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1524  branched-chain amino acid aminotransferase  55.87 
 
 		 367 aa  396  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  57.63 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229178  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3543  branched-chain amino acid aminotransferase  53.42 
 
 		 367 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417874  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2940  branched-chain amino acid aminotransferase  54.14 
 
 		 367 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7786  branched-chain amino acid aminotransferase  51.79 
 
 		 365 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8041  branched-chain amino acid aminotransferase  54.57 
 
 		 364 aa  391  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6535  branched-chain amino acid aminotransferase  53.37 
 
 		 372 aa  391  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3069  branched-chain amino acid aminotransferase  53.13 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.702338  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2919  branched chain amino acid aminotransferase  53.89 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742816  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3573  branched-chain amino acid aminotransferase  53.02 
 
 		 367 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0805126  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09890  branched chain amino acid aminotransferase  52.02 
 
 		 373 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.03528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10560  branched chain amino acid aminotransferase  56.2 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.114756 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3319  branched-chain amino acid aminotransferase  55.52 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12238  branched-chain amino acid aminotransferase  53.17 
 
 		 368 aa  383  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127743  normal  0.533205 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3308  branched-chain amino acid aminotransferase  55.52 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0708  branched-chain amino acid aminotransferase  53.31 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315028 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3370  branched-chain amino acid aminotransferase  55.52 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.142913 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1703  branched-chain amino acid aminotransferase  54.21 
 
 		 375 aa  378  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0434544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2529  branched chain amino acid aminotransferase  53.7 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0747  branched-chain amino acid aminotransferase  48.75 
 
 		 368 aa  376  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.031248  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04566  branched-chain amino acid aminotransferase  54.84 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2267  branched-chain amino acid aminotransferase  52.88 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097897 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3367  branched chain amino acid aminotransferase  53.22 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215737  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6410  branched-chain amino acid aminotransferase  54.3 
 
 		 374 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.545027 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2588  branched-chain amino acid aminotransferase  48.46 
 
 		 354 aa  363  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000807633  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0975  branched-chain amino acid aminotransferase  51.82 
 
 		 362 aa  362  4e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.568362  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6122  branched-chain amino acid aminotransferase  53.67 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0857  branched-chain amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 362 aa  358  6e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2382  branched-chain amino acid aminotransferase  53.02 
 
 		 377 aa  354  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10790  branched chain amino acid aminotransferase  53.31 
 
 		 374 aa  353  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1418  branched-chain amino acid aminotransferase  52.94 
 
 		 377 aa  345  6e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0586  branched-chain amino acid aminotransferase  47.62 
 
 		 375 aa  341  1e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0858  branched-chain-amino-acid transaminase  47.47 
 
 		 389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2144  branched-chain amino acid aminotransferase  48.92 
 
 		 358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  48.95 
 
 		 357 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000422235  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0656  branched-chain amino acid aminotransferase  48.86 
 
 		 357 aa  332  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0585  branched-chain amino acid aminotransferase  48.35 
 
 		 356 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279686 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1168  branched-chain amino acid aminotransferase  54.9 
 
 		 368 aa  330  3e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.882569  normal  0.0790533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2638  branched-chain amino acid aminotransferase  46.22 
 
 		 359 aa  328  7e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000340961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0572  branched-chain amino acid aminotransferase  47.75 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000149445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2853  branched-chain amino acid aminotransferase  48.65 
 
 		 357 aa  326  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000542483  hitchhiker  0.0000000111677 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08600  branched chain amino acid aminotransferase  50.28 
 
 		 363 aa  325  1e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.367777  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  48.29 
 
 		 357 aa  325  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.467391  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2596  branched-chain amino acid aminotransferase  47.75 
 
 		 362 aa  315  6e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  47.62 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.335464  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0537  branched-chain amino acid aminotransferase  44.61 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0856  branched chain amino acid aminotransferase  47.02 
 
 		 356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2663  branched-chain amino acid aminotransferase  46.85 
 
 		 353 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3098  branched-chain amino acid aminotransferase  45.48 
 
 		 357 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0195  branched-chain amino acid aminotransferase  43.09 
 
 		 358 aa  292  6e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3428  branched-chain amino acid aminotransferase  45.71 
 
 		 353 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18760  branched chain amino acid aminotransferase  47.09 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0591  branched-chain amino acid aminotransferase  45.02 
 
 		 358 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0577  branched-chain amino acid aminotransferase  45.02 
 
 		 358 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3509  branched-chain amino acid aminotransferase  44.72 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3577  branched-chain amino acid aminotransferase  44.6 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0889  branched chain amino acid aminotransferase  40.57 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2817  branched chain amino acid aminotransferase  39.94 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0259  branched-chain amino acid aminotransferase  40.43 
 
 		 354 aa  259  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1098  branched-chain amino acid aminotransferase  41.02 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0823676  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0278  branched-chain amino acid aminotransferase  39.61 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3303  branched-chain amino acid aminotransferase  38.5 
 
 		 355 aa  246  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0327  branched-chain amino acid aminotransferase  40.17 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3299  branched-chain amino acid aminotransferase  39 
 
 		 361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  38.86 
 
 		 350 aa  243  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>