More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10560 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_10560  branched chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 367 aa  750    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.114756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  72.48 
 
 		 367 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0616  branched-chain amino acid aminotransferase  69.4 
 
 		 373 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0176  branched-chain amino acid aminotransferase  69.06 
 
 		 371 aa  511  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3069  branched-chain amino acid aminotransferase  66.48 
 
 		 371 aa  504  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.702338  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1524  branched-chain amino acid aminotransferase  68.12 
 
 		 367 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2940  branched-chain amino acid aminotransferase  66.49 
 
 		 367 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3573  branched-chain amino acid aminotransferase  66.76 
 
 		 367 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0805126  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2811  branched-chain amino acid aminotransferase  67.49 
 
 		 363 aa  495  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7786  branched-chain amino acid aminotransferase  63.66 
 
 		 365 aa  493  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12238  branched-chain amino acid aminotransferase  64.77 
 
 		 368 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127743  normal  0.533205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3543  branched-chain amino acid aminotransferase  61.48 
 
 		 367 aa  488  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3319  branched-chain amino acid aminotransferase  66.94 
 
 		 368 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3370  branched-chain amino acid aminotransferase  66.94 
 
 		 368 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.142913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3308  branched-chain amino acid aminotransferase  66.94 
 
 		 368 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8041  branched-chain amino acid aminotransferase  63.86 
 
 		 364 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  67.31 
 
 		 363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229178  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3957  branched-chain amino acid aminotransferase  60.44 
 
 		 379 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04566  branched-chain amino acid aminotransferase  59.56 
 
 		 359 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0708  branched-chain amino acid aminotransferase  58.15 
 
 		 364 aa  437  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4288  branched-chain amino acid aminotransferase  57.34 
 
 		 365 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0711  branched chain amino acid aminotransferase  59.28 
 
 		 361 aa  437  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1240  branched-chain amino acid aminotransferase  57.78 
 
 		 365 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  56.16 
 
 		 366 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4107  branched-chain amino acid aminotransferase  56.16 
 
 		 366 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2529  branched chain amino acid aminotransferase  57.1 
 
 		 370 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0975  branched-chain amino acid aminotransferase  57.02 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0778  branched-chain amino acid aminotransferase  58.24 
 
 		 359 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0857  branched-chain amino acid aminotransferase  56.75 
 
 		 362 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2671  branched-chain amino acid aminotransferase  56.63 
 
 		 367 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2267  branched-chain amino acid aminotransferase  56.57 
 
 		 370 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097897 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2919  branched chain amino acid aminotransferase  57.34 
 
 		 366 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742816  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6535  branched-chain amino acid aminotransferase  55.9 
 
 		 372 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1130  branched-chain amino acid aminotransferase  58.89 
 
 		 365 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2520  branched-chain amino acid aminotransferase  56.82 
 
 		 370 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.11259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1353  branched-chain amino acid aminotransferase  59.39 
 
 		 374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.393805  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3886  branched-chain amino acid aminotransferase  56.67 
 
 		 370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4084  branched-chain amino acid aminotransferase  59.27 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1393  Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase protein  53.89 
 
 		 367 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4282  branched-chain amino acid aminotransferase  53.59 
 
 		 364 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342544  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0726  branched-chain amino acid aminotransferase  56.82 
 
 		 364 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.275399 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3139  branched-chain amino acid aminotransferase  55.99 
 
 		 370 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0047  branched-chain amino acid aminotransferase  54.34 
 
 		 361 aa  398  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0747  branched-chain amino acid aminotransferase  48.91 
 
 		 368 aa  400  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.031248  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3425  branched-chain amino acid aminotransferase  58.12 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4175  branched-chain amino acid aminotransferase  55.83 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1388  branched-chain amino acid aminotransferase  53.99 
 
 		 370 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632887  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1327  branched-chain amino acid aminotransferase  54.78 
 
 		 354 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1358  branched-chain amino acid aminotransferase  54.78 
 
 		 354 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1739  branched-chain amino acid aminotransferase  55.83 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829629  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5588  branched-chain amino acid aminotransferase  54.55 
 
 		 362 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3367  branched chain amino acid aminotransferase  53.72 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215737  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2487  branched-chain amino acid aminotransferase  57.93 
 
 		 366 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1418  branched-chain amino acid aminotransferase  57.5 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0586  branched-chain amino acid aminotransferase  51.12 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6122  branched-chain amino acid aminotransferase  54.28 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5661  branched-chain amino acid aminotransferase  54.62 
 
 		 365 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2742  branched-chain amino acid aminotransferase  56.9 
 
 		 366 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08600  branched chain amino acid aminotransferase  55.28 
 
 		 363 aa  381  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.367777  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6410  branched-chain amino acid aminotransferase  52.53 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.545027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09890  branched chain amino acid aminotransferase  53.72 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.03528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1703  branched-chain amino acid aminotransferase  53.06 
 
 		 375 aa  378  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0434544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3725  branched-chain amino acid aminotransferase  54.34 
 
 		 365 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4643  branched-chain amino acid aminotransferase  54.34 
 
 		 365 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2382  branched-chain amino acid aminotransferase  54.89 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2588  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000807633  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4854  branched-chain amino acid aminotransferase  54.42 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10790  branched chain amino acid aminotransferase  57.02 
 
 		 374 aa  363  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0858  branched-chain-amino-acid transaminase  48.74 
 
 		 389 aa  361  9e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2638  branched-chain amino acid aminotransferase  47.61 
 
 		 359 aa  347  3e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000340961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0572  branched-chain amino acid aminotransferase  48.82 
 
 		 356 aa  344  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000149445  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0195  branched-chain amino acid aminotransferase  47.38 
 
 		 358 aa  343  2e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2596  branched-chain amino acid aminotransferase  48.66 
 
 		 362 aa  343  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18760  branched chain amino acid aminotransferase  51.78 
 
 		 363 aa  340  2e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0537  branched-chain amino acid aminotransferase  47.75 
 
 		 356 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0656  branched-chain amino acid aminotransferase  48.22 
 
 		 357 aa  338  8e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622258  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  49.11 
 
 		 357 aa  338  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000422235  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0577  branched-chain amino acid aminotransferase  46.07 
 
 		 358 aa  337  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0591  branched-chain amino acid aminotransferase  46.07 
 
 		 358 aa  337  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0585  branched-chain amino acid aminotransferase  48.22 
 
 		 356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279686 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  47.03 
 
 		 357 aa  335  9e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.467391  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2663  branched-chain amino acid aminotransferase  48.5 
 
 		 353 aa  333  3e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2144  branched-chain amino acid aminotransferase  47.37 
 
 		 358 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2853  branched-chain amino acid aminotransferase  47.04 
 
 		 357 aa  332  8e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000542483  hitchhiker  0.0000000111677 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  43.17 
 
 		 356 aa  327  3e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.335464  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1168  branched-chain amino acid aminotransferase  55 
 
 		 368 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.882569  normal  0.0790533 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0856  branched chain amino acid aminotransferase  45.81 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3428  branched-chain amino acid aminotransferase  46.24 
 
 		 353 aa  315  7e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3577  branched-chain amino acid aminotransferase  45.68 
 
 		 353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3509  branched-chain amino acid aminotransferase  45.96 
 
 		 353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3098  branched-chain amino acid aminotransferase  46.88 
 
 		 357 aa  312  4.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0889  branched chain amino acid aminotransferase  39.61 
 
 		 355 aa  289  6e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0259  branched-chain amino acid aminotransferase  42.34 
 
 		 354 aa  289  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1098  branched-chain amino acid aminotransferase  41.93 
 
 		 356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0823676  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2817  branched chain amino acid aminotransferase  38.46 
 
 		 358 aa  271  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1604  branched-chain amino acid aminotransferase  41.01 
 
 		 368 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.591229 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00980  hypothetical protein  41.18 
 
 		 437 aa  264  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34985  predicted protein  43.84 
 
 		 371 aa  264  2e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.127685  normal  0.13999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3303  branched-chain amino acid aminotransferase  39.82 
 
 		 355 aa  262  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  39.13 
 
 		 350 aa  262  8e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>