More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0572 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0572  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 356 aa  730    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000149445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0585  branched-chain amino acid aminotransferase  95.51 
 
 		 356 aa  701    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0656  branched-chain amino acid aminotransferase  77.25 
 
 		 357 aa  591  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2853  branched-chain amino acid aminotransferase  76.97 
 
 		 357 aa  593  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000542483  hitchhiker  0.0000000111677 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  78.37 
 
 		 357 aa  590  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000422235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2638  branched-chain amino acid aminotransferase  72.47 
 
 		 359 aa  553  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000340961  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  71.75 
 
 		 357 aa  549  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.467391  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2588  branched-chain amino acid aminotransferase  58.15 
 
 		 354 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000807633  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2144  branched-chain amino acid aminotransferase  57.58 
 
 		 358 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3098  branched-chain amino acid aminotransferase  54.67 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0537  branched-chain amino acid aminotransferase  54.01 
 
 		 356 aa  391  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  53.39 
 
 		 356 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.335464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0856  branched chain amino acid aminotransferase  52.1 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2940  branched-chain amino acid aminotransferase  51.48 
 
 		 367 aa  364  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0195  branched-chain amino acid aminotransferase  52.46 
 
 		 358 aa  360  1e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2663  branched-chain amino acid aminotransferase  50.72 
 
 		 353 aa  360  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1524  branched-chain amino acid aminotransferase  52.66 
 
 		 367 aa  358  6e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3573  branched-chain amino acid aminotransferase  50.89 
 
 		 367 aa  358  8e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0805126  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2596  branched-chain amino acid aminotransferase  50.7 
 
 		 362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12238  branched-chain amino acid aminotransferase  47.9 
 
 		 368 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127743  normal  0.533205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2671  branched-chain amino acid aminotransferase  53.89 
 
 		 367 aa  355  7.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0577  branched-chain amino acid aminotransferase  52.54 
 
 		 358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0591  branched-chain amino acid aminotransferase  52.54 
 
 		 358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0778  branched-chain amino acid aminotransferase  50.72 
 
 		 359 aa  352  8e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4107  branched-chain amino acid aminotransferase  48.32 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456695 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  48.32 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4282  branched-chain amino acid aminotransferase  51.35 
 
 		 364 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342544  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1393  Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase protein  50.43 
 
 		 367 aa  349  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  49.7 
 
 		 367 aa  349  4e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4175  branched-chain amino acid aminotransferase  49.43 
 
 		 371 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0047  branched-chain amino acid aminotransferase  49 
 
 		 361 aa  348  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3543  branched-chain amino acid aminotransferase  51.18 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417874  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3069  branched-chain amino acid aminotransferase  51.03 
 
 		 371 aa  346  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.702338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8041  branched-chain amino acid aminotransferase  49.15 
 
 		 364 aa  345  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5588  branched-chain amino acid aminotransferase  50.3 
 
 		 362 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3319  branched-chain amino acid aminotransferase  50.59 
 
 		 368 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1240  branched-chain amino acid aminotransferase  47.91 
 
 		 365 aa  344  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3308  branched-chain amino acid aminotransferase  50.59 
 
 		 368 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3370  branched-chain amino acid aminotransferase  50.59 
 
 		 368 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.142913 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5661  branched-chain amino acid aminotransferase  50.14 
 
 		 365 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3957  branched-chain amino acid aminotransferase  46.29 
 
 		 379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3725  branched-chain amino acid aminotransferase  50.14 
 
 		 365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20757  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2811  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 		 363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4643  branched-chain amino acid aminotransferase  50.14 
 
 		 365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3886  branched-chain amino acid aminotransferase  48.29 
 
 		 370 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0616  branched-chain amino acid aminotransferase  49.58 
 
 		 373 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0711  branched chain amino acid aminotransferase  45.51 
 
 		 361 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2382  branched-chain amino acid aminotransferase  50.15 
 
 		 377 aa  339  5e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  51.34 
 
 		 363 aa  339  5e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229178  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1388  branched-chain amino acid aminotransferase  48.57 
 
 		 370 aa  338  8e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632887  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7786  branched-chain amino acid aminotransferase  50.3 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0726  branched-chain amino acid aminotransferase  50.15 
 
 		 364 aa  336  2.9999999999999997e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.275399 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1327  branched-chain amino acid aminotransferase  49.4 
 
 		 354 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1358  branched-chain amino acid aminotransferase  49.4 
 
 		 354 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3139  branched-chain amino acid aminotransferase  48.25 
 
 		 370 aa  335  5.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04566  branched-chain amino acid aminotransferase  51.49 
 
 		 359 aa  333  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3425  branched-chain amino acid aminotransferase  47.86 
 
 		 365 aa  332  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0975  branched-chain amino acid aminotransferase  49.85 
 
 		 362 aa  329  4e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.568362  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2520  branched-chain amino acid aminotransferase  47.75 
 
 		 370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.11259 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0857  branched-chain amino acid aminotransferase  49.55 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4288  branched-chain amino acid aminotransferase  47.6 
 
 		 365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0708  branched-chain amino acid aminotransferase  48.8 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0176  branched-chain amino acid aminotransferase  48.52 
 
 		 371 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10560  branched chain amino acid aminotransferase  48.82 
 
 		 367 aa  325  9e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.114756 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1130  branched-chain amino acid aminotransferase  47.63 
 
 		 365 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6410  branched-chain amino acid aminotransferase  48.25 
 
 		 374 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.545027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2529  branched chain amino acid aminotransferase  46.22 
 
 		 370 aa  322  7e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6122  branched-chain amino acid aminotransferase  47.95 
 
 		 354 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1739  branched-chain amino acid aminotransferase  48 
 
 		 359 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829629  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0747  branched-chain amino acid aminotransferase  45.01 
 
 		 368 aa  318  7e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.031248  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2919  branched chain amino acid aminotransferase  47.93 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742816  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2742  branched-chain amino acid aminotransferase  47.9 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2487  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 		 366 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3367  branched chain amino acid aminotransferase  46.09 
 
 		 357 aa  316  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215737  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0259  branched-chain amino acid aminotransferase  43.4 
 
 		 354 aa  315  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6535  branched-chain amino acid aminotransferase  44.81 
 
 		 372 aa  314  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0858  branched-chain-amino-acid transaminase  45.95 
 
 		 389 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4084  branched-chain amino acid aminotransferase  49.4 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10790  branched chain amino acid aminotransferase  49 
 
 		 374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3428  branched-chain amino acid aminotransferase  43.59 
 
 		 353 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1703  branched-chain amino acid aminotransferase  47.75 
 
 		 375 aa  312  5.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0434544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4854  branched-chain amino acid aminotransferase  46.57 
 
 		 370 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1418  branched-chain amino acid aminotransferase  49.85 
 
 		 377 aa  310  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3577  branched-chain amino acid aminotransferase  43.3 
 
 		 353 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3509  branched-chain amino acid aminotransferase  43.59 
 
 		 353 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0889  branched chain amino acid aminotransferase  43.73 
 
 		 355 aa  308  8e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2267  branched-chain amino acid aminotransferase  45.86 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097897 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08600  branched chain amino acid aminotransferase  47.19 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.367777  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0586  branched-chain amino acid aminotransferase  44.51 
 
 		 375 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09890  branched chain amino acid aminotransferase  45.93 
 
 		 373 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.03528 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2817  branched chain amino acid aminotransferase  41.42 
 
 		 358 aa  301  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1353  branched-chain amino acid aminotransferase  47.9 
 
 		 374 aa  300  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.393805  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3303  branched-chain amino acid aminotransferase  43.49 
 
 		 355 aa  298  8e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0327  branched-chain amino acid aminotransferase  43.52 
 
 		 363 aa  295  6e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0406  branched-chain amino acid aminotransferase  42.94 
 
 		 362 aa  295  8e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4176  branched-chain amino acid aminotransferase  43.52 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.575055 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0278  branched-chain amino acid aminotransferase  42.78 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3299  branched-chain amino acid aminotransferase  42.22 
 
 		 361 aa  290  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1098  branched-chain amino acid aminotransferase  41 
 
 		 356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0823676  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43697  predicted protein  44.29 
 
 		 356 aa  288  8e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.908451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>