More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0856 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0856  branched chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 356 aa  726    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  77.25 
 
 		 356 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.335464  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0537  branched-chain amino acid aminotransferase  66.67 
 
 		 356 aa  482  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0195  branched-chain amino acid aminotransferase  56.74 
 
 		 358 aa  422  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2663  branched-chain amino acid aminotransferase  55.46 
 
 		 353 aa  420  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0591  branched-chain amino acid aminotransferase  55.34 
 
 		 358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0577  branched-chain amino acid aminotransferase  55.34 
 
 		 358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3098  branched-chain amino acid aminotransferase  54.21 
 
 		 357 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  51.42 
 
 		 357 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000422235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0585  branched-chain amino acid aminotransferase  51.85 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0572  branched-chain amino acid aminotransferase  52.1 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000149445  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0656  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622258  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2638  branched-chain amino acid aminotransferase  49.57 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000340961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2588  branched-chain amino acid aminotransferase  49.01 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000807633  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2853  branched-chain amino acid aminotransferase  50.7 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000542483  hitchhiker  0.0000000111677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.467391  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3577  branched-chain amino acid aminotransferase  46.97 
 
 		 353 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3428  branched-chain amino acid aminotransferase  47.26 
 
 		 353 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3509  branched-chain amino acid aminotransferase  47.26 
 
 		 353 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2144  branched-chain amino acid aminotransferase  49.3 
 
 		 358 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12238  branched-chain amino acid aminotransferase  45.73 
 
 		 368 aa  348  6e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127743  normal  0.533205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2817  branched chain amino acid aminotransferase  48.58 
 
 		 358 aa  345  8e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2596  branched-chain amino acid aminotransferase  48.86 
 
 		 362 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3573  branched-chain amino acid aminotransferase  45.58 
 
 		 367 aa  342  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0805126  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2940  branched-chain amino acid aminotransferase  45.03 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1524  branched-chain amino acid aminotransferase  44.1 
 
 		 367 aa  339  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  45.88 
 
 		 367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8041  branched-chain amino acid aminotransferase  45.43 
 
 		 364 aa  336  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0889  branched chain amino acid aminotransferase  48.44 
 
 		 355 aa  333  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4107  branched-chain amino acid aminotransferase  46.46 
 
 		 366 aa  329  6e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456695 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  46.46 
 
 		 366 aa  329  6e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2267  branched-chain amino acid aminotransferase  45.66 
 
 		 370 aa  328  9e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3069  branched-chain amino acid aminotransferase  44.11 
 
 		 371 aa  327  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.702338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04566  branched-chain amino acid aminotransferase  45.56 
 
 		 359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7786  branched-chain amino acid aminotransferase  44.72 
 
 		 365 aa  327  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0711  branched chain amino acid aminotransferase  44.63 
 
 		 361 aa  327  3e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2671  branched-chain amino acid aminotransferase  44.79 
 
 		 367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3543  branched-chain amino acid aminotransferase  44.69 
 
 		 367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417874  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0778  branched-chain amino acid aminotransferase  45 
 
 		 359 aa  325  6e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6535  branched-chain amino acid aminotransferase  46.87 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05235  branched-chain amino acid aminotransferase  50.15 
 
 		 353 aa  323  4e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3370  branched-chain amino acid aminotransferase  46.33 
 
 		 368 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.142913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3319  branched-chain amino acid aminotransferase  46.33 
 
 		 368 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3308  branched-chain amino acid aminotransferase  46.33 
 
 		 368 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2811  branched-chain amino acid aminotransferase  45.04 
 
 		 363 aa  322  8e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2529  branched chain amino acid aminotransferase  45.66 
 
 		 370 aa  322  9.000000000000001e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3957  branched-chain amino acid aminotransferase  44.14 
 
 		 379 aa  321  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3303  branched-chain amino acid aminotransferase  45.61 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0708  branched-chain amino acid aminotransferase  43.54 
 
 		 364 aa  319  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315028 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1703  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 		 375 aa  318  6e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0434544 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09890  branched chain amino acid aminotransferase  45.21 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.03528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1098  branched-chain amino acid aminotransferase  43.5 
 
 		 356 aa  316  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0823676  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  44.72 
 
 		 363 aa  316  4e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229178  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0259  branched-chain amino acid aminotransferase  42.81 
 
 		 354 aa  315  7e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1393  Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase protein  44.51 
 
 		 367 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0616  branched-chain amino acid aminotransferase  43.91 
 
 		 373 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3886  branched-chain amino acid aminotransferase  47.06 
 
 		 370 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4288  branched-chain amino acid aminotransferase  43.1 
 
 		 365 aa  312  5.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0726  branched-chain amino acid aminotransferase  45.4 
 
 		 364 aa  312  5.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.275399 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1327  branched-chain amino acid aminotransferase  46.25 
 
 		 354 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1358  branched-chain amino acid aminotransferase  46.25 
 
 		 354 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0975  branched-chain amino acid aminotransferase  45.37 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.568362  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0176  branched-chain amino acid aminotransferase  43.06 
 
 		 371 aa  309  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0857  branched-chain amino acid aminotransferase  45.07 
 
 		 362 aa  309  5.9999999999999995e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3139  branched-chain amino acid aminotransferase  45.83 
 
 		 370 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0047  branched-chain amino acid aminotransferase  42.81 
 
 		 361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1240  branched-chain amino acid aminotransferase  41.46 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1388  branched-chain amino acid aminotransferase  46.33 
 
 		 370 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632887  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2487  branched-chain amino acid aminotransferase  46.09 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4282  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 		 364 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342544  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3367  branched chain amino acid aminotransferase  45.35 
 
 		 357 aa  305  7e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215737  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5588  branched-chain amino acid aminotransferase  44.29 
 
 		 362 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2520  branched-chain amino acid aminotransferase  47.02 
 
 		 370 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.11259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10560  branched chain amino acid aminotransferase  45.81 
 
 		 367 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.114756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2382  branched-chain amino acid aminotransferase  45.59 
 
 		 377 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4175  branched-chain amino acid aminotransferase  46.33 
 
 		 371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2919  branched chain amino acid aminotransferase  43.86 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742816  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1604  branched-chain amino acid aminotransferase  41.81 
 
 		 368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.591229 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3649  branched-chain amino acid aminotransferase  45.64 
 
 		 363 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0858  branched-chain-amino-acid transaminase  43.62 
 
 		 389 aa  301  8.000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0414  branched-chain amino acid aminotransferase  45.35 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.718054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2742  branched-chain amino acid aminotransferase  44.94 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0340  branched-chain amino acid aminotransferase  45.06 
 
 		 363 aa  299  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3634  branched-chain amino acid aminotransferase  45.35 
 
 		 363 aa  299  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0310  branched-chain amino acid aminotransferase  45.35 
 
 		 363 aa  299  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3830  branched-chain amino acid aminotransferase  45.35 
 
 		 363 aa  299  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0278  branched-chain amino acid aminotransferase  43.79 
 
 		 363 aa  298  9e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4084  branched-chain amino acid aminotransferase  45.05 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4854  branched-chain amino acid aminotransferase  46.91 
 
 		 370 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0747  branched-chain amino acid aminotransferase  43.03 
 
 		 368 aa  297  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.031248  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0289  branched-chain amino acid aminotransferase  45 
 
 		 363 aa  295  7e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.351269  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0406  branched-chain amino acid aminotransferase  44.12 
 
 		 362 aa  295  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  43.06 
 
 		 350 aa  294  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3299  branched-chain amino acid aminotransferase  43.82 
 
 		 361 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0327  branched-chain amino acid aminotransferase  44.25 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4176  branched-chain amino acid aminotransferase  44.61 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.575055 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1353  branched-chain amino acid aminotransferase  44.85 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.393805  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07060  branched-chain amino acid aminotransferase  42.05 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0360453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3425  branched-chain amino acid aminotransferase  43.71 
 
 		 365 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1739  branched-chain amino acid aminotransferase  44.6 
 
 		 359 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829629  normal  0.133325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>