More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3577 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3428  branched-chain amino acid aminotransferase  95.47 
 
 
353 aa  673    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3577  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
353 aa  700    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3509  branched-chain amino acid aminotransferase  99.15 
 
 
353 aa  696    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  49.01 
 
 
356 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.335464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0856  branched chain amino acid aminotransferase  46.97 
 
 
356 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2663  branched-chain amino acid aminotransferase  47.31 
 
 
353 aa  364  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0537  branched-chain amino acid aminotransferase  46.86 
 
 
356 aa  346  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0195  branched-chain amino acid aminotransferase  45.98 
 
 
358 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2588  branched-chain amino acid aminotransferase  46.05 
 
 
354 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000807633  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0577  branched-chain amino acid aminotransferase  44.83 
 
 
358 aa  325  6e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2671  branched-chain amino acid aminotransferase  48.17 
 
 
367 aa  325  6e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0591  branched-chain amino acid aminotransferase  44.83 
 
 
358 aa  325  6e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0726  branched-chain amino acid aminotransferase  48.87 
 
 
364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.275399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04566  branched-chain amino acid aminotransferase  48.73 
 
 
359 aa  315  8e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1393  Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase protein  49.1 
 
 
367 aa  312  6.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3098  branched-chain amino acid aminotransferase  44.93 
 
 
357 aa  311  6.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0047  branched-chain amino acid aminotransferase  47.86 
 
 
361 aa  311  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3367  branched chain amino acid aminotransferase  47.34 
 
 
357 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0585  branched-chain amino acid aminotransferase  42.74 
 
 
356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  43.59 
 
 
357 aa  309  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000422235  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0572  branched-chain amino acid aminotransferase  43.3 
 
 
356 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000149445  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  45.45 
 
 
367 aa  308  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2853  branched-chain amino acid aminotransferase  43.14 
 
 
357 aa  308  9e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000542483  hitchhiker  0.0000000111677 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0711  branched chain amino acid aminotransferase  44.72 
 
 
361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1703  branched-chain amino acid aminotransferase  47.29 
 
 
375 aa  305  8.000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0434544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1524  branched-chain amino acid aminotransferase  45.56 
 
 
367 aa  304  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2638  branched-chain amino acid aminotransferase  43.92 
 
 
359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000340961  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0778  branched-chain amino acid aminotransferase  48.2 
 
 
359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08600  branched chain amino acid aminotransferase  51.49 
 
 
363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.367777  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0975  branched-chain amino acid aminotransferase  48.04 
 
 
362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.568362  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2919  branched chain amino acid aminotransferase  46.33 
 
 
366 aa  302  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3069  branched-chain amino acid aminotransferase  44.48 
 
 
371 aa  302  5.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.702338  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2817  branched chain amino acid aminotransferase  39.6 
 
 
358 aa  302  7.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12238  branched-chain amino acid aminotransferase  46.57 
 
 
368 aa  300  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127743  normal  0.533205 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0857  branched-chain amino acid aminotransferase  47.43 
 
 
362 aa  299  4e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0656  branched-chain amino acid aminotransferase  44.48 
 
 
357 aa  297  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2144  branched-chain amino acid aminotransferase  42.13 
 
 
358 aa  297  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2529  branched chain amino acid aminotransferase  46.41 
 
 
370 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0176  branched-chain amino acid aminotransferase  46.57 
 
 
371 aa  297  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  45.63 
 
 
366 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4107  branched-chain amino acid aminotransferase  45.63 
 
 
366 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.456695 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2382  branched-chain amino acid aminotransferase  46.67 
 
 
377 aa  296  3e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0616  branched-chain amino acid aminotransferase  45.97 
 
 
373 aa  296  3e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7786  branched-chain amino acid aminotransferase  45.27 
 
 
365 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0889  branched chain amino acid aminotransferase  39.83 
 
 
355 aa  296  4e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10560  branched chain amino acid aminotransferase  45.68 
 
 
367 aa  295  6e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.114756 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4282  branched-chain amino acid aminotransferase  46.02 
 
 
364 aa  295  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3303  branched-chain amino acid aminotransferase  42.05 
 
 
355 aa  295  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0747  branched-chain amino acid aminotransferase  39.61 
 
 
368 aa  295  8e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.031248  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3543  branched-chain amino acid aminotransferase  41.16 
 
 
367 aa  295  8e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  41.88 
 
 
357 aa  295  9e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.467391  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2940  branched-chain amino acid aminotransferase  43.66 
 
 
367 aa  294  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3573  branched-chain amino acid aminotransferase  44.23 
 
 
367 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0805126  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2267  branched-chain amino acid aminotransferase  45.58 
 
 
370 aa  294  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097897 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0708  branched-chain amino acid aminotransferase  45.3 
 
 
364 aa  293  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.315028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8041  branched-chain amino acid aminotransferase  44.21 
 
 
364 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1240  branched-chain amino acid aminotransferase  46.11 
 
 
365 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2811  branched-chain amino acid aminotransferase  43.41 
 
 
363 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642497  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4084  branched-chain amino acid aminotransferase  47.28 
 
 
359 aa  290  4e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3957  branched-chain amino acid aminotransferase  45.88 
 
 
379 aa  289  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0259  branched-chain amino acid aminotransferase  42.17 
 
 
354 aa  289  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581012  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1327  branched-chain amino acid aminotransferase  45.43 
 
 
354 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1358  branched-chain amino acid aminotransferase  45.43 
 
 
354 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2487  branched-chain amino acid aminotransferase  47.32 
 
 
366 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1418  branched-chain amino acid aminotransferase  48.15 
 
 
377 aa  285  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.935473 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2596  branched-chain amino acid aminotransferase  40.24 
 
 
362 aa  285  7e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1098  branched-chain amino acid aminotransferase  41.79 
 
 
356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0823676  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10790  branched chain amino acid aminotransferase  48.48 
 
 
374 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  45.33 
 
 
363 aa  281  8.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229178  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1388  branched-chain amino acid aminotransferase  46.27 
 
 
370 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632887  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4288  branched-chain amino acid aminotransferase  43.71 
 
 
365 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2520  branched-chain amino acid aminotransferase  44.6 
 
 
370 aa  278  9e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.11259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2742  branched-chain amino acid aminotransferase  46.2 
 
 
366 aa  278  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5588  branched-chain amino acid aminotransferase  44.08 
 
 
362 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0289083  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3308  branched-chain amino acid aminotransferase  45.27 
 
 
368 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3319  branched-chain amino acid aminotransferase  45.27 
 
 
368 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3370  branched-chain amino acid aminotransferase  45.27 
 
 
368 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.142913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4175  branched-chain amino acid aminotransferase  44.63 
 
 
371 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121006  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3139  branched-chain amino acid aminotransferase  44.82 
 
 
370 aa  275  8e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3425  branched-chain amino acid aminotransferase  46.73 
 
 
365 aa  275  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1353  branched-chain amino acid aminotransferase  48.34 
 
 
374 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.393805  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3886  branched-chain amino acid aminotransferase  45.29 
 
 
370 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184711  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09890  branched chain amino acid aminotransferase  43.93 
 
 
373 aa  271  9e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.03528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1168  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 
368 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.882569  normal  0.0790533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1130  branched-chain amino acid aminotransferase  46.25 
 
 
365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6410  branched-chain amino acid aminotransferase  40.62 
 
 
374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.545027 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07060  branched-chain amino acid aminotransferase  37.78 
 
 
357 aa  269  5e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0360453  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1739  branched-chain amino acid aminotransferase  45.43 
 
 
359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.829629  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05235  branched-chain amino acid aminotransferase  39.55 
 
 
353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6122  branched-chain amino acid aminotransferase  41.23 
 
 
354 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  37.14 
 
 
350 aa  267  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0586  branched-chain amino acid aminotransferase  42.73 
 
 
375 aa  266  4e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3725  branched-chain amino acid aminotransferase  45.45 
 
 
365 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4643  branched-chain amino acid aminotransferase  45.45 
 
 
365 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5661  branched-chain amino acid aminotransferase  45.45 
 
 
365 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6535  branched-chain amino acid aminotransferase  39.33 
 
 
372 aa  265  7e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1604  branched-chain amino acid aminotransferase  39.54 
 
 
368 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.591229 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00980  hypothetical protein  37.91 
 
 
437 aa  261  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18760  branched chain amino acid aminotransferase  45.48 
 
 
363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0618  putative branched-chain amino acid aminotransferase  41.83 
 
 
363 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>